Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtpbp4Q99ME9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtpbp4Q99ME9 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtpbp4Q99ME9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gtpbp4Q99ME9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gtpbp4Q99ME9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gtpbp4Q99ME9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gtpbp4Q99ME9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gtpbp4Q99ME9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gtpbp4Q99ME9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gtpbp4Q99ME9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gtpbp4Q99ME9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gtpbp4Q99ME9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gtpbp4Q99ME9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Gtpbp4Q99ME9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gtpbp4Q99ME9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtpbp4Q99ME9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtpbp4Q99ME9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtpbp4Q99ME9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtpbp4Q99ME9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtpbp4Q99ME9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtpbp4Q99ME9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtpbp4Q99ME9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtpbp4Q99ME9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtpbp4Q99ME9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtpbp4Q99ME9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtpbp4Q99ME9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtpbp4Q99ME9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gtpbp4Q99ME9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gtpbp4Q99ME9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gtpbp4Q99ME9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gtpbp4Q99ME9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Gtpbp4Q99ME9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gtpbp4Q99ME9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gtpbp4Q99ME9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gtpbp4Q99ME9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gtpbp4Q99ME9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gtpbp4Q99ME9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gtpbp4Q99ME9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gtpbp4Q99ME9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtpbp4Q99ME9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtpbp4Q99ME9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtpbp4Q99ME9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtpbp4Q99ME9 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtpbp4Q99ME9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtpbp4Q99ME9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtpbp4Q99ME9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtpbp4Q99ME9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtpbp4Q99ME9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtpbp4Q99ME9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtpbp4Q99ME9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtpbp4Q99ME9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtpbp4Q99ME9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtpbp4Q99ME9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtpbp4Q99ME9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtpbp4Q99ME9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtpbp4Q99ME9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtpbp4Q99ME9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtpbp4Q99ME9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtpbp4Q99ME9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtpbp4Q99ME9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtpbp4Q99ME9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtpbp4Q99ME9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtpbp4Q99ME9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtpbp4Q99ME9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtpbp4Q99ME9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtpbp4Q99ME9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtpbp4Q99ME9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtpbp4Q99ME9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtpbp4Q99ME9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtpbp4Q99ME9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtpbp4Q99ME9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtpbp4Q99ME9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtpbp4Q99ME9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtpbp4Q99ME9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtpbp4Q99ME9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtpbp4Q99ME9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtpbp4Q99ME9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtpbp4Q99ME9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtpbp4Q99ME9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtpbp4Q99ME9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtpbp4Q99ME9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtpbp4Q99ME9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtpbp4Q99ME9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtpbp4Q99ME9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtpbp4Q99ME9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtpbp4Q99ME9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtpbp4Q99ME9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtpbp4Q99ME9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtpbp4Q99ME9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtpbp4Q99ME9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtpbp4Q99ME9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtpbp4Q99ME9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtpbp4Q99ME9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtpbp4Q99ME9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtpbp4Q99ME9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtpbp4Q99ME9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtpbp4Q99ME9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtpbp4Q99ME9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtpbp4Q99ME9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms