Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB7

Rnf141, RING finger protein 141, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf141Q99MB7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf141Q99MB7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf141Q99MB7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf141Q99MB7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf141Q99MB7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf141Q99MB7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf141Q99MB7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf141Q99MB7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf141Q99MB7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf141Q99MB7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf141Q99MB7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf141Q99MB7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf141Q99MB7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf141Q99MB7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf141Q99MB7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf141Q99MB7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf141Q99MB7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf141Q99MB7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf141Q99MB7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf141Q99MB7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf141Q99MB7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf141Q99MB7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf141Q99MB7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf141Q99MB7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf141Q99MB7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf141Q99MB7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf141Q99MB7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf141Q99MB7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf141Q99MB7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf141Q99MB7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf141Q99MB7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf141Q99MB7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf141Q99MB7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf141Q99MB7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf141Q99MB7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf141Q99MB7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf141Q99MB7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf141Q99MB7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf141Q99MB7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf141Q99MB7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf141Q99MB7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf141Q99MB7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf141Q99MB7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf141Q99MB7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf141Q99MB7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf141Q99MB7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf141Q99MB7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf141Q99MB7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf141Q99MB7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf141Q99MB7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf141Q99MB7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf141Q99MB7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf141Q99MB7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf141Q99MB7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf141Q99MB7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf141Q99MB7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf141Q99MB7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf141Q99MB7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf141Q99MB7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf141Q99MB7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf141Q99MB7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf141Q99MB7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf141Q99MB7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf141Q99MB7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf141Q99MB7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf141Q99MB7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf141Q99MB7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf141Q99MB7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf141Q99MB7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf141Q99MB7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf141Q99MB7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf141Q99MB7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf141Q99MB7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf141Q99MB7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf141Q99MB7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf141Q99MB7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf141Q99MB7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf141Q99MB7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf141Q99MB7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf141Q99MB7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf141Q99MB7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf141Q99MB7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf141Q99MB7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf141Q99MB7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf141Q99MB7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf141Q99MB7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf141Q99MB7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf141Q99MB7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf141Q99MB7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf141Q99MB7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf141Q99MB7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf141Q99MB7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf141Q99MB7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf141Q99MB7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf141Q99MB7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf141Q99MB7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf141Q99MB7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf141Q99MB7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf141Q99MB7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf141Q99MB7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms