Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gps1Q99LD4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gps1Q99LD4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gps1Q99LD4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gps1Q99LD4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gps1Q99LD4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gps1Q99LD4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gps1Q99LD4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gps1Q99LD4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gps1Q99LD4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gps1Q99LD4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gps1Q99LD4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gps1Q99LD4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gps1Q99LD4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gps1Q99LD4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gps1Q99LD4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gps1Q99LD4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gps1Q99LD4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gps1Q99LD4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gps1Q99LD4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gps1Q99LD4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gps1Q99LD4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gps1Q99LD4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gps1Q99LD4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gps1Q99LD4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gps1Q99LD4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gps1Q99LD4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gps1Q99LD4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gps1Q99LD4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gps1Q99LD4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gps1Q99LD4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gps1Q99LD4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gps1Q99LD4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gps1Q99LD4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gps1Q99LD4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gps1Q99LD4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gps1Q99LD4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gps1Q99LD4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gps1Q99LD4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gps1Q99LD4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gps1Q99LD4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gps1Q99LD4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gps1Q99LD4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gps1Q99LD4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gps1Q99LD4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gps1Q99LD4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gps1Q99LD4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gps1Q99LD4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gps1Q99LD4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gps1Q99LD4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gps1Q99LD4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gps1Q99LD4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gps1Q99LD4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gps1Q99LD4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gps1Q99LD4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gps1Q99LD4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gps1Q99LD4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gps1Q99LD4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gps1Q99LD4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gps1Q99LD4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gps1Q99LD4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gps1Q99LD4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gps1Q99LD4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gps1Q99LD4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gps1Q99LD4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gps1Q99LD4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gps1Q99LD4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gps1Q99LD4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gps1Q99LD4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gps1Q99LD4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gps1Q99LD4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gps1Q99LD4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gps1Q99LD4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gps1Q99LD4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gps1Q99LD4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gps1Q99LD4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gps1Q99LD4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gps1Q99LD4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gps1Q99LD4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gps1Q99LD4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gps1Q99LD4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gps1Q99LD4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gps1Q99LD4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gps1Q99LD4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gps1Q99LD4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gps1Q99LD4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gps1Q99LD4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gps1Q99LD4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gps1Q99LD4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gps1Q99LD4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gps1Q99LD4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gps1Q99LD4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gps1Q99LD4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gps1Q99LD4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gps1Q99LD4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gps1Q99LD4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gps1Q99LD4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gps1Q99LD4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gps1Q99LD4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gps1Q99LD4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms