Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TriobpQ99KW3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TriobpQ99KW3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TriobpQ99KW3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TriobpQ99KW3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TriobpQ99KW3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TriobpQ99KW3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TriobpQ99KW3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TriobpQ99KW3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TriobpQ99KW3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TriobpQ99KW3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TriobpQ99KW3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TriobpQ99KW3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TriobpQ99KW3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TriobpQ99KW3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TriobpQ99KW3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TriobpQ99KW3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TriobpQ99KW3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TriobpQ99KW3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TriobpQ99KW3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TriobpQ99KW3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TriobpQ99KW3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TriobpQ99KW3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TriobpQ99KW3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TriobpQ99KW3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TriobpQ99KW3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TriobpQ99KW3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TriobpQ99KW3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TriobpQ99KW3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TriobpQ99KW3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TriobpQ99KW3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TriobpQ99KW3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TriobpQ99KW3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TriobpQ99KW3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TriobpQ99KW3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TriobpQ99KW3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TriobpQ99KW3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TriobpQ99KW3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TriobpQ99KW3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TriobpQ99KW3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TriobpQ99KW3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TriobpQ99KW3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TriobpQ99KW3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TriobpQ99KW3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TriobpQ99KW3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TriobpQ99KW3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TriobpQ99KW3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TriobpQ99KW3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TriobpQ99KW3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TriobpQ99KW3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TriobpQ99KW3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TriobpQ99KW3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TriobpQ99KW3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TriobpQ99KW3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TriobpQ99KW3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TriobpQ99KW3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TriobpQ99KW3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TriobpQ99KW3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TriobpQ99KW3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TriobpQ99KW3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TriobpQ99KW3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TriobpQ99KW3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TriobpQ99KW3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TriobpQ99KW3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TriobpQ99KW3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TriobpQ99KW3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TriobpQ99KW3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TriobpQ99KW3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TriobpQ99KW3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TriobpQ99KW3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TriobpQ99KW3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TriobpQ99KW3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TriobpQ99KW3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TriobpQ99KW3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TriobpQ99KW3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TriobpQ99KW3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TriobpQ99KW3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TriobpQ99KW3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TriobpQ99KW3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TriobpQ99KW3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TriobpQ99KW3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TriobpQ99KW3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TriobpQ99KW3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TriobpQ99KW3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TriobpQ99KW3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TriobpQ99KW3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TriobpQ99KW3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TriobpQ99KW3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TriobpQ99KW3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TriobpQ99KW3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TriobpQ99KW3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TriobpQ99KW3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TriobpQ99KW3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TriobpQ99KW3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TriobpQ99KW3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TriobpQ99KW3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TriobpQ99KW3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TriobpQ99KW3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TriobpQ99KW3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TriobpQ99KW3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms