Protein–RNA interactions for Protein: Q925E1

Sntg1, Gamma-1-syntrophin, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sntg1Q925E1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sntg1Q925E1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sntg1Q925E1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sntg1Q925E1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sntg1Q925E1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sntg1Q925E1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sntg1Q925E1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sntg1Q925E1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sntg1Q925E1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sntg1Q925E1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sntg1Q925E1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sntg1Q925E1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sntg1Q925E1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sntg1Q925E1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sntg1Q925E1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sntg1Q925E1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sntg1Q925E1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sntg1Q925E1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sntg1Q925E1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sntg1Q925E1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sntg1Q925E1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sntg1Q925E1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sntg1Q925E1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sntg1Q925E1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sntg1Q925E1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sntg1Q925E1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sntg1Q925E1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sntg1Q925E1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sntg1Q925E1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sntg1Q925E1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sntg1Q925E1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sntg1Q925E1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sntg1Q925E1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sntg1Q925E1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Sntg1Q925E1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sntg1Q925E1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sntg1Q925E1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sntg1Q925E1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sntg1Q925E1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sntg1Q925E1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sntg1Q925E1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sntg1Q925E1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sntg1Q925E1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sntg1Q925E1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sntg1Q925E1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sntg1Q925E1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Sntg1Q925E1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sntg1Q925E1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms