Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smg8Q8VE18 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smg8Q8VE18 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smg8Q8VE18 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smg8Q8VE18 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smg8Q8VE18 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smg8Q8VE18 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smg8Q8VE18 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smg8Q8VE18 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smg8Q8VE18 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smg8Q8VE18 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smg8Q8VE18 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smg8Q8VE18 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smg8Q8VE18 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smg8Q8VE18 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smg8Q8VE18 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smg8Q8VE18 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smg8Q8VE18 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smg8Q8VE18 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smg8Q8VE18 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smg8Q8VE18 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Smg8Q8VE18 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smg8Q8VE18 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smg8Q8VE18 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smg8Q8VE18 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smg8Q8VE18 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smg8Q8VE18 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smg8Q8VE18 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smg8Q8VE18 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smg8Q8VE18 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smg8Q8VE18 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smg8Q8VE18 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smg8Q8VE18 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smg8Q8VE18 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Smg8Q8VE18 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smg8Q8VE18 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smg8Q8VE18 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smg8Q8VE18 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smg8Q8VE18 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smg8Q8VE18 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smg8Q8VE18 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smg8Q8VE18 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smg8Q8VE18 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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Smg8Q8VE18 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smg8Q8VE18 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smg8Q8VE18 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Smg8Q8VE18 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smg8Q8VE18 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smg8Q8VE18 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Smg8Q8VE18 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smg8Q8VE18 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smg8Q8VE18 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smg8Q8VE18 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smg8Q8VE18 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smg8Q8VE18 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smg8Q8VE18 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Smg8Q8VE18 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Smg8Q8VE18 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Smg8Q8VE18 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Smg8Q8VE18 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Smg8Q8VE18 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smg8Q8VE18 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smg8Q8VE18 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smg8Q8VE18 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smg8Q8VE18 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smg8Q8VE18 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smg8Q8VE18 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Smg8Q8VE18 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smg8Q8VE18 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smg8Q8VE18 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smg8Q8VE18 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smg8Q8VE18 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smg8Q8VE18 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smg8Q8VE18 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smg8Q8VE18 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smg8Q8VE18 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Smg8Q8VE18 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smg8Q8VE18 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Smg8Q8VE18 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smg8Q8VE18 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smg8Q8VE18 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smg8Q8VE18 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smg8Q8VE18 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smg8Q8VE18 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smg8Q8VE18 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smg8Q8VE18 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smg8Q8VE18 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smg8Q8VE18 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smg8Q8VE18 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smg8Q8VE18 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smg8Q8VE18 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smg8Q8VE18 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smg8Q8VE18 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smg8Q8VE18 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smg8Q8VE18 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Smg8Q8VE18 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smg8Q8VE18 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smg8Q8VE18 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smg8Q8VE18 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms