Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9M2

Ccdc15, Coiled-coil domain-containing protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc15Q8C9M2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc15Q8C9M2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc15Q8C9M2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc15Q8C9M2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc15Q8C9M2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc15Q8C9M2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc15Q8C9M2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc15Q8C9M2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc15Q8C9M2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc15Q8C9M2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc15Q8C9M2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc15Q8C9M2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc15Q8C9M2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc15Q8C9M2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc15Q8C9M2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc15Q8C9M2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc15Q8C9M2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc15Q8C9M2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc15Q8C9M2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc15Q8C9M2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc15Q8C9M2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc15Q8C9M2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc15Q8C9M2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc15Q8C9M2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc15Q8C9M2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc15Q8C9M2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc15Q8C9M2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc15Q8C9M2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc15Q8C9M2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc15Q8C9M2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc15Q8C9M2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc15Q8C9M2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc15Q8C9M2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc15Q8C9M2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc15Q8C9M2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc15Q8C9M2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc15Q8C9M2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc15Q8C9M2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc15Q8C9M2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc15Q8C9M2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc15Q8C9M2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc15Q8C9M2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc15Q8C9M2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc15Q8C9M2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc15Q8C9M2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc15Q8C9M2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc15Q8C9M2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc15Q8C9M2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc15Q8C9M2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc15Q8C9M2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc15Q8C9M2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc15Q8C9M2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc15Q8C9M2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc15Q8C9M2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc15Q8C9M2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc15Q8C9M2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc15Q8C9M2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc15Q8C9M2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc15Q8C9M2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc15Q8C9M2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc15Q8C9M2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc15Q8C9M2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc15Q8C9M2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc15Q8C9M2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc15Q8C9M2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc15Q8C9M2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc15Q8C9M2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc15Q8C9M2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc15Q8C9M2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc15Q8C9M2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc15Q8C9M2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc15Q8C9M2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc15Q8C9M2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc15Q8C9M2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc15Q8C9M2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc15Q8C9M2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc15Q8C9M2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc15Q8C9M2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc15Q8C9M2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc15Q8C9M2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc15Q8C9M2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc15Q8C9M2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc15Q8C9M2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc15Q8C9M2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc15Q8C9M2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc15Q8C9M2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc15Q8C9M2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc15Q8C9M2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc15Q8C9M2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc15Q8C9M2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc15Q8C9M2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc15Q8C9M2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc15Q8C9M2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc15Q8C9M2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc15Q8C9M2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc15Q8C9M2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc15Q8C9M2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc15Q8C9M2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc15Q8C9M2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc15Q8C9M2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms