Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP86

Snapc4, snRNA-activating protein complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc4Q8BP86 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Snapc4Q8BP86 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Snapc4Q8BP86 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Snapc4Q8BP86 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Snapc4Q8BP86 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Snapc4Q8BP86 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Snapc4Q8BP86 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Snapc4Q8BP86 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Snapc4Q8BP86 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snapc4Q8BP86 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snapc4Q8BP86 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snapc4Q8BP86 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snapc4Q8BP86 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snapc4Q8BP86 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Snapc4Q8BP86 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snapc4Q8BP86 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snapc4Q8BP86 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snapc4Q8BP86 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snapc4Q8BP86 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snapc4Q8BP86 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snapc4Q8BP86 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snapc4Q8BP86 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snapc4Q8BP86 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snapc4Q8BP86 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Snapc4Q8BP86 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Snapc4Q8BP86 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snapc4Q8BP86 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snapc4Q8BP86 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snapc4Q8BP86 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snapc4Q8BP86 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snapc4Q8BP86 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snapc4Q8BP86 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snapc4Q8BP86 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snapc4Q8BP86 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snapc4Q8BP86 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Snapc4Q8BP86 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snapc4Q8BP86 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snapc4Q8BP86 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snapc4Q8BP86 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snapc4Q8BP86 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snapc4Q8BP86 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snapc4Q8BP86 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snapc4Q8BP86 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snapc4Q8BP86 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snapc4Q8BP86 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snapc4Q8BP86 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snapc4Q8BP86 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snapc4Q8BP86 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snapc4Q8BP86 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Snapc4Q8BP86 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snapc4Q8BP86 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snapc4Q8BP86 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snapc4Q8BP86 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Snapc4Q8BP86 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Snapc4Q8BP86 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snapc4Q8BP86 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snapc4Q8BP86 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snapc4Q8BP86 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Snapc4Q8BP86 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snapc4Q8BP86 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snapc4Q8BP86 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snapc4Q8BP86 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snapc4Q8BP86 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snapc4Q8BP86 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snapc4Q8BP86 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snapc4Q8BP86 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snapc4Q8BP86 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snapc4Q8BP86 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snapc4Q8BP86 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snapc4Q8BP86 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snapc4Q8BP86 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snapc4Q8BP86 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snapc4Q8BP86 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snapc4Q8BP86 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snapc4Q8BP86 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snapc4Q8BP86 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snapc4Q8BP86 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snapc4Q8BP86 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snapc4Q8BP86 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Snapc4Q8BP86 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snapc4Q8BP86 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snapc4Q8BP86 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snapc4Q8BP86 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snapc4Q8BP86 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Snapc4Q8BP86 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Snapc4Q8BP86 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Snapc4Q8BP86 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Snapc4Q8BP86 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Snapc4Q8BP86 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Snapc4Q8BP86 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Snapc4Q8BP86 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Snapc4Q8BP86 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Snapc4Q8BP86 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snapc4Q8BP86 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snapc4Q8BP86 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Snapc4Q8BP86 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snapc4Q8BP86 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snapc4Q8BP86 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Snapc4Q8BP86 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Snapc4Q8BP86 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms