Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg4dQ8BGV9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg4dQ8BGV9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg4dQ8BGV9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg4dQ8BGV9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg4dQ8BGV9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg4dQ8BGV9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg4dQ8BGV9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg4dQ8BGV9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg4dQ8BGV9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg4dQ8BGV9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg4dQ8BGV9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg4dQ8BGV9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg4dQ8BGV9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg4dQ8BGV9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg4dQ8BGV9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg4dQ8BGV9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg4dQ8BGV9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg4dQ8BGV9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg4dQ8BGV9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg4dQ8BGV9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg4dQ8BGV9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg4dQ8BGV9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg4dQ8BGV9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg4dQ8BGV9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg4dQ8BGV9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg4dQ8BGV9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg4dQ8BGV9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg4dQ8BGV9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg4dQ8BGV9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg4dQ8BGV9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg4dQ8BGV9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg4dQ8BGV9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg4dQ8BGV9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg4dQ8BGV9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg4dQ8BGV9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg4dQ8BGV9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg4dQ8BGV9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg4dQ8BGV9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg4dQ8BGV9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg4dQ8BGV9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg4dQ8BGV9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg4dQ8BGV9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg4dQ8BGV9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg4dQ8BGV9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg4dQ8BGV9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg4dQ8BGV9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg4dQ8BGV9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg4dQ8BGV9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg4dQ8BGV9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg4dQ8BGV9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg4dQ8BGV9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg4dQ8BGV9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg4dQ8BGV9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg4dQ8BGV9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg4dQ8BGV9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg4dQ8BGV9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg4dQ8BGV9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg4dQ8BGV9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atg4dQ8BGV9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atg4dQ8BGV9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg4dQ8BGV9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg4dQ8BGV9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg4dQ8BGV9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg4dQ8BGV9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg4dQ8BGV9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg4dQ8BGV9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg4dQ8BGV9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg4dQ8BGV9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg4dQ8BGV9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg4dQ8BGV9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg4dQ8BGV9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg4dQ8BGV9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg4dQ8BGV9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg4dQ8BGV9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg4dQ8BGV9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg4dQ8BGV9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg4dQ8BGV9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg4dQ8BGV9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg4dQ8BGV9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Atg4dQ8BGV9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Atg4dQ8BGV9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Atg4dQ8BGV9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Atg4dQ8BGV9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Atg4dQ8BGV9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Atg4dQ8BGV9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Atg4dQ8BGV9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg4dQ8BGV9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg4dQ8BGV9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg4dQ8BGV9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg4dQ8BGV9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg4dQ8BGV9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg4dQ8BGV9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg4dQ8BGV9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg4dQ8BGV9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg4dQ8BGV9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg4dQ8BGV9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg4dQ8BGV9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg4dQ8BGV9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg4dQ8BGV9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms