Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smchd1Q6P5D8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smchd1Q6P5D8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smchd1Q6P5D8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smchd1Q6P5D8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smchd1Q6P5D8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smchd1Q6P5D8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smchd1Q6P5D8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Smchd1Q6P5D8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smchd1Q6P5D8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smchd1Q6P5D8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smchd1Q6P5D8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smchd1Q6P5D8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smchd1Q6P5D8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smchd1Q6P5D8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smchd1Q6P5D8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Smchd1Q6P5D8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smchd1Q6P5D8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smchd1Q6P5D8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smchd1Q6P5D8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smchd1Q6P5D8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smchd1Q6P5D8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smchd1Q6P5D8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smchd1Q6P5D8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smchd1Q6P5D8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smchd1Q6P5D8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smchd1Q6P5D8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smchd1Q6P5D8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smchd1Q6P5D8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smchd1Q6P5D8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smchd1Q6P5D8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smchd1Q6P5D8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smchd1Q6P5D8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smchd1Q6P5D8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smchd1Q6P5D8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smchd1Q6P5D8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smchd1Q6P5D8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smchd1Q6P5D8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smchd1Q6P5D8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smchd1Q6P5D8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smchd1Q6P5D8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smchd1Q6P5D8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smchd1Q6P5D8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Smchd1Q6P5D8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smchd1Q6P5D8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smchd1Q6P5D8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Smchd1Q6P5D8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Smchd1Q6P5D8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Smchd1Q6P5D8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smchd1Q6P5D8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Smchd1Q6P5D8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Smchd1Q6P5D8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Smchd1Q6P5D8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Smchd1Q6P5D8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Smchd1Q6P5D8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smchd1Q6P5D8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smchd1Q6P5D8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Smchd1Q6P5D8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smchd1Q6P5D8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smchd1Q6P5D8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smchd1Q6P5D8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smchd1Q6P5D8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smchd1Q6P5D8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Smchd1Q6P5D8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Smchd1Q6P5D8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smchd1Q6P5D8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smchd1Q6P5D8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Smchd1Q6P5D8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Smchd1Q6P5D8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smchd1Q6P5D8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smchd1Q6P5D8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smchd1Q6P5D8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Smchd1Q6P5D8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smchd1Q6P5D8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smchd1Q6P5D8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Smchd1Q6P5D8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Smchd1Q6P5D8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smchd1Q6P5D8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smchd1Q6P5D8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smchd1Q6P5D8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smchd1Q6P5D8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smchd1Q6P5D8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Smchd1Q6P5D8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smchd1Q6P5D8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smchd1Q6P5D8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smchd1Q6P5D8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Smchd1Q6P5D8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smchd1Q6P5D8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smchd1Q6P5D8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smchd1Q6P5D8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smchd1Q6P5D8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Smchd1Q6P5D8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Smchd1Q6P5D8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Smchd1Q6P5D8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smchd1Q6P5D8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smchd1Q6P5D8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smchd1Q6P5D8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smchd1Q6P5D8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smchd1Q6P5D8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smchd1Q6P5D8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
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