Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQT6

Scap, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScapQ6GQT6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ScapQ6GQT6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ScapQ6GQT6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ScapQ6GQT6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ScapQ6GQT6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ScapQ6GQT6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ScapQ6GQT6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ScapQ6GQT6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ScapQ6GQT6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ScapQ6GQT6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ScapQ6GQT6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ScapQ6GQT6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ScapQ6GQT6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ScapQ6GQT6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ScapQ6GQT6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ScapQ6GQT6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ScapQ6GQT6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ScapQ6GQT6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ScapQ6GQT6 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ScapQ6GQT6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ScapQ6GQT6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ScapQ6GQT6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ScapQ6GQT6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ScapQ6GQT6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ScapQ6GQT6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ScapQ6GQT6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ScapQ6GQT6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ScapQ6GQT6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ScapQ6GQT6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ScapQ6GQT6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ScapQ6GQT6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ScapQ6GQT6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ScapQ6GQT6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ScapQ6GQT6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ScapQ6GQT6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ScapQ6GQT6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ScapQ6GQT6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ScapQ6GQT6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ScapQ6GQT6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ScapQ6GQT6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ScapQ6GQT6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ScapQ6GQT6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ScapQ6GQT6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ScapQ6GQT6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ScapQ6GQT6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ScapQ6GQT6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ScapQ6GQT6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ScapQ6GQT6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ScapQ6GQT6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ScapQ6GQT6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ScapQ6GQT6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ScapQ6GQT6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ScapQ6GQT6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ScapQ6GQT6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ScapQ6GQT6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ScapQ6GQT6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ScapQ6GQT6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ScapQ6GQT6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ScapQ6GQT6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ScapQ6GQT6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ScapQ6GQT6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ScapQ6GQT6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ScapQ6GQT6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ScapQ6GQT6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ScapQ6GQT6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ScapQ6GQT6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ScapQ6GQT6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ScapQ6GQT6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ScapQ6GQT6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ScapQ6GQT6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ScapQ6GQT6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ScapQ6GQT6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ScapQ6GQT6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ScapQ6GQT6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ScapQ6GQT6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ScapQ6GQT6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ScapQ6GQT6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ScapQ6GQT6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ScapQ6GQT6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ScapQ6GQT6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ScapQ6GQT6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ScapQ6GQT6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ScapQ6GQT6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ScapQ6GQT6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ScapQ6GQT6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ScapQ6GQT6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ScapQ6GQT6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ScapQ6GQT6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ScapQ6GQT6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ScapQ6GQT6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ScapQ6GQT6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ScapQ6GQT6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ScapQ6GQT6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ScapQ6GQT6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ScapQ6GQT6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ScapQ6GQT6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ScapQ6GQT6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ScapQ6GQT6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ScapQ6GQT6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ScapQ6GQT6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms