Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atg9aQ68FE2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atg9aQ68FE2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atg9aQ68FE2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atg9aQ68FE2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atg9aQ68FE2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atg9aQ68FE2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atg9aQ68FE2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atg9aQ68FE2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atg9aQ68FE2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atg9aQ68FE2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atg9aQ68FE2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atg9aQ68FE2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atg9aQ68FE2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atg9aQ68FE2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atg9aQ68FE2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atg9aQ68FE2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atg9aQ68FE2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atg9aQ68FE2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atg9aQ68FE2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atg9aQ68FE2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atg9aQ68FE2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atg9aQ68FE2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atg9aQ68FE2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atg9aQ68FE2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atg9aQ68FE2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atg9aQ68FE2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atg9aQ68FE2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atg9aQ68FE2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atg9aQ68FE2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atg9aQ68FE2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atg9aQ68FE2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atg9aQ68FE2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atg9aQ68FE2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atg9aQ68FE2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Atg9aQ68FE2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atg9aQ68FE2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atg9aQ68FE2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atg9aQ68FE2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atg9aQ68FE2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atg9aQ68FE2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atg9aQ68FE2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atg9aQ68FE2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atg9aQ68FE2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg9aQ68FE2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg9aQ68FE2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg9aQ68FE2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg9aQ68FE2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg9aQ68FE2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg9aQ68FE2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg9aQ68FE2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg9aQ68FE2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg9aQ68FE2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg9aQ68FE2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg9aQ68FE2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg9aQ68FE2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg9aQ68FE2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg9aQ68FE2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg9aQ68FE2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg9aQ68FE2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg9aQ68FE2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg9aQ68FE2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atg9aQ68FE2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atg9aQ68FE2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atg9aQ68FE2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Atg9aQ68FE2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atg9aQ68FE2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atg9aQ68FE2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Atg9aQ68FE2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atg9aQ68FE2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atg9aQ68FE2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atg9aQ68FE2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atg9aQ68FE2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atg9aQ68FE2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atg9aQ68FE2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Atg9aQ68FE2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atg9aQ68FE2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atg9aQ68FE2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atg9aQ68FE2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atg9aQ68FE2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atg9aQ68FE2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atg9aQ68FE2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atg9aQ68FE2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atg9aQ68FE2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atg9aQ68FE2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atg9aQ68FE2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atg9aQ68FE2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atg9aQ68FE2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atg9aQ68FE2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atg9aQ68FE2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atg9aQ68FE2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Atg9aQ68FE2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atg9aQ68FE2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atg9aQ68FE2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Atg9aQ68FE2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Atg9aQ68FE2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atg9aQ68FE2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atg9aQ68FE2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atg9aQ68FE2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atg9aQ68FE2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms