Protein–RNA interactions for Protein: Q66X01

Nlrp9c, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9C, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp9cQ66X01 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nlrp9cQ66X01 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nlrp9cQ66X01 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nlrp9cQ66X01 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nlrp9cQ66X01 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nlrp9cQ66X01 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nlrp9cQ66X01 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nlrp9cQ66X01 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nlrp9cQ66X01 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nlrp9cQ66X01 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nlrp9cQ66X01 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nlrp9cQ66X01 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nlrp9cQ66X01 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nlrp9cQ66X01 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nlrp9cQ66X01 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nlrp9cQ66X01 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nlrp9cQ66X01 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nlrp9cQ66X01 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nlrp9cQ66X01 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nlrp9cQ66X01 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms