Protein–RNA interactions for Protein: Q60753

Ctf1, Cardiotrophin-1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctf1Q60753 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctf1Q60753 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctf1Q60753 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctf1Q60753 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctf1Q60753 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctf1Q60753 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctf1Q60753 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctf1Q60753 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctf1Q60753 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctf1Q60753 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctf1Q60753 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctf1Q60753 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctf1Q60753 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctf1Q60753 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctf1Q60753 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctf1Q60753 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctf1Q60753 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctf1Q60753 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctf1Q60753 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctf1Q60753 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctf1Q60753 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctf1Q60753 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctf1Q60753 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctf1Q60753 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctf1Q60753 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctf1Q60753 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctf1Q60753 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms