Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Psme4Q5SSW2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psme4Q5SSW2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psme4Q5SSW2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psme4Q5SSW2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psme4Q5SSW2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psme4Q5SSW2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Psme4Q5SSW2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psme4Q5SSW2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psme4Q5SSW2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psme4Q5SSW2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psme4Q5SSW2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psme4Q5SSW2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psme4Q5SSW2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psme4Q5SSW2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psme4Q5SSW2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psme4Q5SSW2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psme4Q5SSW2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psme4Q5SSW2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psme4Q5SSW2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psme4Q5SSW2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psme4Q5SSW2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psme4Q5SSW2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psme4Q5SSW2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psme4Q5SSW2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psme4Q5SSW2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psme4Q5SSW2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psme4Q5SSW2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psme4Q5SSW2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psme4Q5SSW2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psme4Q5SSW2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psme4Q5SSW2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Psme4Q5SSW2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psme4Q5SSW2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psme4Q5SSW2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psme4Q5SSW2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psme4Q5SSW2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psme4Q5SSW2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psme4Q5SSW2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psme4Q5SSW2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psme4Q5SSW2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psme4Q5SSW2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psme4Q5SSW2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psme4Q5SSW2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psme4Q5SSW2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psme4Q5SSW2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psme4Q5SSW2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psme4Q5SSW2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psme4Q5SSW2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psme4Q5SSW2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psme4Q5SSW2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psme4Q5SSW2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psme4Q5SSW2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psme4Q5SSW2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Psme4Q5SSW2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Psme4Q5SSW2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psme4Q5SSW2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psme4Q5SSW2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psme4Q5SSW2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psme4Q5SSW2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psme4Q5SSW2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psme4Q5SSW2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psme4Q5SSW2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psme4Q5SSW2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psme4Q5SSW2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psme4Q5SSW2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psme4Q5SSW2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psme4Q5SSW2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psme4Q5SSW2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psme4Q5SSW2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psme4Q5SSW2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psme4Q5SSW2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psme4Q5SSW2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psme4Q5SSW2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psme4Q5SSW2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psme4Q5SSW2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psme4Q5SSW2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psme4Q5SSW2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psme4Q5SSW2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psme4Q5SSW2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psme4Q5SSW2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psme4Q5SSW2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psme4Q5SSW2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psme4Q5SSW2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psme4Q5SSW2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psme4Q5SSW2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psme4Q5SSW2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psme4Q5SSW2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psme4Q5SSW2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psme4Q5SSW2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psme4Q5SSW2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psme4Q5SSW2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psme4Q5SSW2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psme4Q5SSW2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Psme4Q5SSW2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psme4Q5SSW2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psme4Q5SSW2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psme4Q5SSW2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psme4Q5SSW2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psme4Q5SSW2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms