Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Trappc1Q5NCF2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trappc1Q5NCF2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trappc1Q5NCF2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trappc1Q5NCF2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trappc1Q5NCF2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trappc1Q5NCF2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trappc1Q5NCF2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trappc1Q5NCF2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trappc1Q5NCF2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trappc1Q5NCF2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trappc1Q5NCF2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trappc1Q5NCF2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trappc1Q5NCF2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Trappc1Q5NCF2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc1Q5NCF2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc1Q5NCF2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc1Q5NCF2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc1Q5NCF2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc1Q5NCF2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc1Q5NCF2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc1Q5NCF2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc1Q5NCF2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc1Q5NCF2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc1Q5NCF2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc1Q5NCF2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc1Q5NCF2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc1Q5NCF2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc1Q5NCF2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc1Q5NCF2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc1Q5NCF2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc1Q5NCF2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc1Q5NCF2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc1Q5NCF2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc1Q5NCF2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc1Q5NCF2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc1Q5NCF2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc1Q5NCF2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc1Q5NCF2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc1Q5NCF2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc1Q5NCF2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc1Q5NCF2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc1Q5NCF2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc1Q5NCF2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc1Q5NCF2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc1Q5NCF2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc1Q5NCF2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc1Q5NCF2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc1Q5NCF2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc1Q5NCF2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc1Q5NCF2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc1Q5NCF2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc1Q5NCF2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc1Q5NCF2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc1Q5NCF2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc1Q5NCF2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc1Q5NCF2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms