Protein–RNA interactions for Protein: Q56A06

Tmtc2, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmtc2Q56A06 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmtc2Q56A06 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmtc2Q56A06 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmtc2Q56A06 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmtc2Q56A06 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmtc2Q56A06 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmtc2Q56A06 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmtc2Q56A06 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmtc2Q56A06 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmtc2Q56A06 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmtc2Q56A06 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmtc2Q56A06 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmtc2Q56A06 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmtc2Q56A06 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmtc2Q56A06 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmtc2Q56A06 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmtc2Q56A06 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmtc2Q56A06 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmtc2Q56A06 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmtc2Q56A06 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmtc2Q56A06 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmtc2Q56A06 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmtc2Q56A06 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmtc2Q56A06 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmtc2Q56A06 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmtc2Q56A06 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmtc2Q56A06 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmtc2Q56A06 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmtc2Q56A06 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmtc2Q56A06 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmtc2Q56A06 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmtc2Q56A06 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmtc2Q56A06 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmtc2Q56A06 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmtc2Q56A06 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmtc2Q56A06 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmtc2Q56A06 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmtc2Q56A06 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmtc2Q56A06 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmtc2Q56A06 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmtc2Q56A06 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmtc2Q56A06 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmtc2Q56A06 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmtc2Q56A06 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmtc2Q56A06 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmtc2Q56A06 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmtc2Q56A06 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmtc2Q56A06 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmtc2Q56A06 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmtc2Q56A06 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmtc2Q56A06 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmtc2Q56A06 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmtc2Q56A06 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmtc2Q56A06 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmtc2Q56A06 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmtc2Q56A06 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmtc2Q56A06 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tmtc2Q56A06 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmtc2Q56A06 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmtc2Q56A06 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmtc2Q56A06 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmtc2Q56A06 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmtc2Q56A06 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmtc2Q56A06 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmtc2Q56A06 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmtc2Q56A06 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmtc2Q56A06 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmtc2Q56A06 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmtc2Q56A06 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmtc2Q56A06 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmtc2Q56A06 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmtc2Q56A06 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmtc2Q56A06 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmtc2Q56A06 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmtc2Q56A06 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmtc2Q56A06 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmtc2Q56A06 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmtc2Q56A06 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmtc2Q56A06 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmtc2Q56A06 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmtc2Q56A06 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmtc2Q56A06 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmtc2Q56A06 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmtc2Q56A06 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmtc2Q56A06 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmtc2Q56A06 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmtc2Q56A06 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmtc2Q56A06 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmtc2Q56A06 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmtc2Q56A06 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmtc2Q56A06 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmtc2Q56A06 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmtc2Q56A06 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmtc2Q56A06 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmtc2Q56A06 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmtc2Q56A06 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmtc2Q56A06 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmtc2Q56A06 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmtc2Q56A06 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmtc2Q56A06 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms