Protein–RNA interactions for Protein: Q3URJ8

Nkain3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkain3Q3URJ8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nkain3Q3URJ8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nkain3Q3URJ8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nkain3Q3URJ8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nkain3Q3URJ8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nkain3Q3URJ8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nkain3Q3URJ8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nkain3Q3URJ8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nkain3Q3URJ8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nkain3Q3URJ8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Nkain3Q3URJ8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nkain3Q3URJ8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nkain3Q3URJ8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nkain3Q3URJ8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nkain3Q3URJ8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nkain3Q3URJ8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nkain3Q3URJ8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nkain3Q3URJ8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Nkain3Q3URJ8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nkain3Q3URJ8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nkain3Q3URJ8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nkain3Q3URJ8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nkain3Q3URJ8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nkain3Q3URJ8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nkain3Q3URJ8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Nkain3Q3URJ8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nkain3Q3URJ8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nkain3Q3URJ8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nkain3Q3URJ8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nkain3Q3URJ8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nkain3Q3URJ8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nkain3Q3URJ8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nkain3Q3URJ8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nkain3Q3URJ8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nkain3Q3URJ8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nkain3Q3URJ8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nkain3Q3URJ8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nkain3Q3URJ8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nkain3Q3URJ8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nkain3Q3URJ8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nkain3Q3URJ8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nkain3Q3URJ8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nkain3Q3URJ8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nkain3Q3URJ8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nkain3Q3URJ8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nkain3Q3URJ8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nkain3Q3URJ8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nkain3Q3URJ8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nkain3Q3URJ8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nkain3Q3URJ8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nkain3Q3URJ8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Nkain3Q3URJ8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Nkain3Q3URJ8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nkain3Q3URJ8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Nkain3Q3URJ8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nkain3Q3URJ8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nkain3Q3URJ8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nkain3Q3URJ8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nkain3Q3URJ8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nkain3Q3URJ8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nkain3Q3URJ8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nkain3Q3URJ8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nkain3Q3URJ8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nkain3Q3URJ8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nkain3Q3URJ8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nkain3Q3URJ8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nkain3Q3URJ8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nkain3Q3URJ8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nkain3Q3URJ8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nkain3Q3URJ8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nkain3Q3URJ8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nkain3Q3URJ8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nkain3Q3URJ8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nkain3Q3URJ8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nkain3Q3URJ8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nkain3Q3URJ8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nkain3Q3URJ8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nkain3Q3URJ8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nkain3Q3URJ8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nkain3Q3URJ8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nkain3Q3URJ8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nkain3Q3URJ8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nkain3Q3URJ8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nkain3Q3URJ8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nkain3Q3URJ8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nkain3Q3URJ8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nkain3Q3URJ8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nkain3Q3URJ8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nkain3Q3URJ8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nkain3Q3URJ8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Nkain3Q3URJ8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nkain3Q3URJ8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nkain3Q3URJ8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nkain3Q3URJ8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nkain3Q3URJ8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nkain3Q3URJ8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nkain3Q3URJ8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nkain3Q3URJ8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Nkain3Q3URJ8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nkain3Q3URJ8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms