Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ulk3Q3U3Q1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ulk3Q3U3Q1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ulk3Q3U3Q1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ulk3Q3U3Q1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ulk3Q3U3Q1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ulk3Q3U3Q1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ulk3Q3U3Q1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ulk3Q3U3Q1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ulk3Q3U3Q1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ulk3Q3U3Q1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ulk3Q3U3Q1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ulk3Q3U3Q1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ulk3Q3U3Q1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ulk3Q3U3Q1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ulk3Q3U3Q1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ulk3Q3U3Q1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ulk3Q3U3Q1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ulk3Q3U3Q1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ulk3Q3U3Q1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ulk3Q3U3Q1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ulk3Q3U3Q1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ulk3Q3U3Q1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ulk3Q3U3Q1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ulk3Q3U3Q1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ulk3Q3U3Q1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ulk3Q3U3Q1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ulk3Q3U3Q1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ulk3Q3U3Q1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ulk3Q3U3Q1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ulk3Q3U3Q1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ulk3Q3U3Q1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ulk3Q3U3Q1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ulk3Q3U3Q1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ulk3Q3U3Q1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ulk3Q3U3Q1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ulk3Q3U3Q1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ulk3Q3U3Q1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ulk3Q3U3Q1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ulk3Q3U3Q1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ulk3Q3U3Q1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ulk3Q3U3Q1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ulk3Q3U3Q1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ulk3Q3U3Q1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ulk3Q3U3Q1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ulk3Q3U3Q1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ulk3Q3U3Q1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ulk3Q3U3Q1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ulk3Q3U3Q1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ulk3Q3U3Q1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ulk3Q3U3Q1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ulk3Q3U3Q1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ulk3Q3U3Q1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ulk3Q3U3Q1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ulk3Q3U3Q1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ulk3Q3U3Q1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ulk3Q3U3Q1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ulk3Q3U3Q1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ulk3Q3U3Q1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ulk3Q3U3Q1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ulk3Q3U3Q1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ulk3Q3U3Q1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ulk3Q3U3Q1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ulk3Q3U3Q1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ulk3Q3U3Q1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ulk3Q3U3Q1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ulk3Q3U3Q1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ulk3Q3U3Q1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ulk3Q3U3Q1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ulk3Q3U3Q1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ulk3Q3U3Q1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ulk3Q3U3Q1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ulk3Q3U3Q1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ulk3Q3U3Q1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ulk3Q3U3Q1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ulk3Q3U3Q1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ulk3Q3U3Q1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ulk3Q3U3Q1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ulk3Q3U3Q1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ulk3Q3U3Q1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ulk3Q3U3Q1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ulk3Q3U3Q1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ulk3Q3U3Q1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ulk3Q3U3Q1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ulk3Q3U3Q1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ulk3Q3U3Q1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ulk3Q3U3Q1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ulk3Q3U3Q1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ulk3Q3U3Q1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ulk3Q3U3Q1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ulk3Q3U3Q1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ulk3Q3U3Q1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ulk3Q3U3Q1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ulk3Q3U3Q1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ulk3Q3U3Q1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ulk3Q3U3Q1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ulk3Q3U3Q1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ulk3Q3U3Q1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ulk3Q3U3Q1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ulk3Q3U3Q1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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