Protein–RNA interactions for Protein: Q3U308

Ctu2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu2Q3U308 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctu2Q3U308 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctu2Q3U308 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctu2Q3U308 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctu2Q3U308 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctu2Q3U308 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctu2Q3U308 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctu2Q3U308 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctu2Q3U308 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctu2Q3U308 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctu2Q3U308 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctu2Q3U308 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctu2Q3U308 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctu2Q3U308 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctu2Q3U308 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctu2Q3U308 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctu2Q3U308 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctu2Q3U308 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctu2Q3U308 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctu2Q3U308 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctu2Q3U308 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctu2Q3U308 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctu2Q3U308 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctu2Q3U308 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctu2Q3U308 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctu2Q3U308 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctu2Q3U308 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctu2Q3U308 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctu2Q3U308 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ctu2Q3U308 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctu2Q3U308 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctu2Q3U308 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctu2Q3U308 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctu2Q3U308 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctu2Q3U308 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctu2Q3U308 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctu2Q3U308 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctu2Q3U308 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctu2Q3U308 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctu2Q3U308 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctu2Q3U308 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctu2Q3U308 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctu2Q3U308 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctu2Q3U308 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctu2Q3U308 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctu2Q3U308 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctu2Q3U308 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctu2Q3U308 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctu2Q3U308 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctu2Q3U308 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctu2Q3U308 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctu2Q3U308 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctu2Q3U308 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctu2Q3U308 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctu2Q3U308 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctu2Q3U308 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctu2Q3U308 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctu2Q3U308 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctu2Q3U308 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctu2Q3U308 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctu2Q3U308 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctu2Q3U308 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctu2Q3U308 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctu2Q3U308 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctu2Q3U308 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctu2Q3U308 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctu2Q3U308 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctu2Q3U308 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctu2Q3U308 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctu2Q3U308 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctu2Q3U308 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctu2Q3U308 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctu2Q3U308 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctu2Q3U308 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctu2Q3U308 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctu2Q3U308 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctu2Q3U308 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctu2Q3U308 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctu2Q3U308 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctu2Q3U308 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctu2Q3U308 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctu2Q3U308 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctu2Q3U308 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctu2Q3U308 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctu2Q3U308 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctu2Q3U308 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctu2Q3U308 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctu2Q3U308 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctu2Q3U308 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctu2Q3U308 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctu2Q3U308 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctu2Q3U308 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctu2Q3U308 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctu2Q3U308 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctu2Q3U308 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctu2Q3U308 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctu2Q3U308 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctu2Q3U308 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctu2Q3U308 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctu2Q3U308 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms