Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Srsf6Q3TWW8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Srsf6Q3TWW8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Srsf6Q3TWW8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Srsf6Q3TWW8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Srsf6Q3TWW8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Srsf6Q3TWW8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Srsf6Q3TWW8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Srsf6Q3TWW8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Srsf6Q3TWW8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Srsf6Q3TWW8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Srsf6Q3TWW8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Srsf6Q3TWW8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Srsf6Q3TWW8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Srsf6Q3TWW8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Srsf6Q3TWW8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Srsf6Q3TWW8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Srsf6Q3TWW8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Srsf6Q3TWW8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Srsf6Q3TWW8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Srsf6Q3TWW8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Srsf6Q3TWW8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Srsf6Q3TWW8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Srsf6Q3TWW8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Srsf6Q3TWW8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Srsf6Q3TWW8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Srsf6Q3TWW8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srsf6Q3TWW8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srsf6Q3TWW8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srsf6Q3TWW8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srsf6Q3TWW8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srsf6Q3TWW8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srsf6Q3TWW8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srsf6Q3TWW8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srsf6Q3TWW8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srsf6Q3TWW8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srsf6Q3TWW8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srsf6Q3TWW8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srsf6Q3TWW8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srsf6Q3TWW8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srsf6Q3TWW8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srsf6Q3TWW8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srsf6Q3TWW8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srsf6Q3TWW8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srsf6Q3TWW8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srsf6Q3TWW8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srsf6Q3TWW8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srsf6Q3TWW8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srsf6Q3TWW8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Srsf6Q3TWW8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Srsf6Q3TWW8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Srsf6Q3TWW8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Srsf6Q3TWW8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Srsf6Q3TWW8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Srsf6Q3TWW8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Srsf6Q3TWW8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Srsf6Q3TWW8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Srsf6Q3TWW8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Srsf6Q3TWW8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Srsf6Q3TWW8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Srsf6Q3TWW8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Srsf6Q3TWW8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srsf6Q3TWW8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srsf6Q3TWW8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srsf6Q3TWW8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srsf6Q3TWW8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srsf6Q3TWW8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srsf6Q3TWW8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srsf6Q3TWW8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srsf6Q3TWW8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srsf6Q3TWW8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srsf6Q3TWW8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srsf6Q3TWW8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srsf6Q3TWW8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srsf6Q3TWW8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Srsf6Q3TWW8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Srsf6Q3TWW8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Srsf6Q3TWW8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Srsf6Q3TWW8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Srsf6Q3TWW8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Srsf6Q3TWW8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Srsf6Q3TWW8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Srsf6Q3TWW8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srsf6Q3TWW8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srsf6Q3TWW8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srsf6Q3TWW8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srsf6Q3TWW8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Srsf6Q3TWW8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srsf6Q3TWW8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srsf6Q3TWW8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srsf6Q3TWW8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srsf6Q3TWW8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srsf6Q3TWW8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srsf6Q3TWW8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srsf6Q3TWW8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srsf6Q3TWW8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srsf6Q3TWW8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srsf6Q3TWW8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srsf6Q3TWW8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srsf6Q3TWW8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms