Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pate4Q09098 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms