Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Siah2Q06986 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Siah2Q06986 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Siah2Q06986 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Siah2Q06986 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Siah2Q06986 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Siah2Q06986 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Siah2Q06986 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Siah2Q06986 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Siah2Q06986 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Siah2Q06986 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Siah2Q06986 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Siah2Q06986 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Siah2Q06986 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms