Protein–RNA interactions for Protein: P38532

Hsf1, Heat shock factor protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hsf1P38532 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hsf1P38532 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hsf1P38532 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hsf1P38532 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hsf1P38532 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hsf1P38532 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hsf1P38532 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hsf1P38532 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hsf1P38532 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hsf1P38532 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hsf1P38532 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hsf1P38532 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hsf1P38532 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hsf1P38532 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hsf1P38532 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hsf1P38532 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hsf1P38532 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hsf1P38532 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hsf1P38532 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hsf1P38532 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hsf1P38532 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hsf1P38532 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hsf1P38532 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hsf1P38532 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hsf1P38532 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hsf1P38532 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hsf1P38532 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hsf1P38532 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hsf1P38532 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hsf1P38532 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hsf1P38532 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hsf1P38532 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Hsf1P38532 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hsf1P38532 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hsf1P38532 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hsf1P38532 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hsf1P38532 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hsf1P38532 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hsf1P38532 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hsf1P38532 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hsf1P38532 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hsf1P38532 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hsf1P38532 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hsf1P38532 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hsf1P38532 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hsf1P38532 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hsf1P38532 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hsf1P38532 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hsf1P38532 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hsf1P38532 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hsf1P38532 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hsf1P38532 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hsf1P38532 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hsf1P38532 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hsf1P38532 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hsf1P38532 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hsf1P38532 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hsf1P38532 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hsf1P38532 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hsf1P38532 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hsf1P38532 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hsf1P38532 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hsf1P38532 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hsf1P38532 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hsf1P38532 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hsf1P38532 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hsf1P38532 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hsf1P38532 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hsf1P38532 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hsf1P38532 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hsf1P38532 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hsf1P38532 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hsf1P38532 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hsf1P38532 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hsf1P38532 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hsf1P38532 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hsf1P38532 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hsf1P38532 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hsf1P38532 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hsf1P38532 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hsf1P38532 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hsf1P38532 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hsf1P38532 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hsf1P38532 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hsf1P38532 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hsf1P38532 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hsf1P38532 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hsf1P38532 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hsf1P38532 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hsf1P38532 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hsf1P38532 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hsf1P38532 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hsf1P38532 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hsf1P38532 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hsf1P38532 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hsf1P38532 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hsf1P38532 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hsf1P38532 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hsf1P38532 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hsf1P38532 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms