Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa10P31310 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa10P31310 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa10P31310 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa10P31310 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa10P31310 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa10P31310 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa10P31310 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa10P31310 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa10P31310 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa10P31310 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa10P31310 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa10P31310 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa10P31310 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa10P31310 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa10P31310 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa10P31310 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa10P31310 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa10P31310 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa10P31310 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa10P31310 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa10P31310 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxa10P31310 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxa10P31310 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxa10P31310 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxa10P31310 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxa10P31310 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxa10P31310 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxa10P31310 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxa10P31310 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa10P31310 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa10P31310 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa10P31310 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa10P31310 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa10P31310 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa10P31310 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa10P31310 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa10P31310 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa10P31310 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa10P31310 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa10P31310 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa10P31310 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa10P31310 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa10P31310 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa10P31310 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa10P31310 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa10P31310 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa10P31310 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa10P31310 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa10P31310 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa10P31310 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa10P31310 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa10P31310 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa10P31310 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa10P31310 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa10P31310 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa10P31310 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa10P31310 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa10P31310 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa10P31310 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa10P31310 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa10P31310 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa10P31310 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa10P31310 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa10P31310 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa10P31310 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa10P31310 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Hoxa10P31310 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Hoxa10P31310 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Hoxa10P31310 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa10P31310 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms