Protein–RNA interactions for Protein: P29452

Casp1, Caspase-1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp1P29452 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Casp1P29452 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Casp1P29452 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Casp1P29452 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Casp1P29452 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Casp1P29452 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Casp1P29452 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Casp1P29452 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Casp1P29452 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Casp1P29452 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Casp1P29452 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Casp1P29452 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Casp1P29452 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Casp1P29452 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Casp1P29452 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Casp1P29452 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Casp1P29452 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Casp1P29452 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Casp1P29452 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Casp1P29452 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Casp1P29452 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Casp1P29452 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Casp1P29452 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Casp1P29452 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Casp1P29452 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Casp1P29452 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Casp1P29452 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Casp1P29452 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Casp1P29452 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Casp1P29452 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Casp1P29452 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Casp1P29452 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Casp1P29452 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Casp1P29452 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Casp1P29452 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Casp1P29452 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Casp1P29452 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Casp1P29452 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Casp1P29452 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Casp1P29452 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Casp1P29452 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Casp1P29452 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Casp1P29452 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Casp1P29452 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Casp1P29452 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Casp1P29452 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Casp1P29452 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Casp1P29452 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Casp1P29452 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Casp1P29452 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Casp1P29452 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Casp1P29452 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Casp1P29452 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Casp1P29452 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Casp1P29452 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Casp1P29452 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Casp1P29452 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Casp1P29452 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Casp1P29452 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Casp1P29452 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Casp1P29452 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Casp1P29452 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Casp1P29452 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Casp1P29452 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Casp1P29452 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Casp1P29452 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Casp1P29452 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Casp1P29452 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Casp1P29452 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Casp1P29452 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Casp1P29452 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Casp1P29452 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Casp1P29452 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Casp1P29452 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Casp1P29452 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Casp1P29452 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Casp1P29452 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Casp1P29452 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Casp1P29452 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Casp1P29452 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Casp1P29452 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Casp1P29452 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Casp1P29452 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Casp1P29452 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Casp1P29452 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Casp1P29452 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Casp1P29452 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Casp1P29452 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Casp1P29452 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Casp1P29452 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Casp1P29452 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Casp1P29452 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Casp1P29452 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Casp1P29452 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Casp1P29452 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Casp1P29452 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Casp1P29452 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Casp1P29452 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Casp1P29452 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Casp1P29452 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms