Protein–RNA interactions for Protein: P19137

Lama1, Laminin subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama1P19137 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lama1P19137 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lama1P19137 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lama1P19137 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lama1P19137 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lama1P19137 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lama1P19137 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lama1P19137 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lama1P19137 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lama1P19137 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lama1P19137 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lama1P19137 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lama1P19137 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lama1P19137 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lama1P19137 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lama1P19137 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lama1P19137 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lama1P19137 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lama1P19137 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Lama1P19137 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lama1P19137 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lama1P19137 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lama1P19137 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lama1P19137 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lama1P19137 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lama1P19137 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lama1P19137 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lama1P19137 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lama1P19137 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lama1P19137 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Lama1P19137 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Lama1P19137 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lama1P19137 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lama1P19137 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lama1P19137 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lama1P19137 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lama1P19137 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lama1P19137 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lama1P19137 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lama1P19137 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lama1P19137 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lama1P19137 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lama1P19137 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lama1P19137 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lama1P19137 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lama1P19137 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Lama1P19137 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Lama1P19137 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lama1P19137 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lama1P19137 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lama1P19137 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lama1P19137 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lama1P19137 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lama1P19137 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lama1P19137 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lama1P19137 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lama1P19137 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lama1P19137 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lama1P19137 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lama1P19137 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lama1P19137 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lama1P19137 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lama1P19137 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lama1P19137 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lama1P19137 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lama1P19137 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lama1P19137 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Lama1P19137 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lama1P19137 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lama1P19137 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lama1P19137 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lama1P19137 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lama1P19137 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lama1P19137 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lama1P19137 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lama1P19137 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lama1P19137 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lama1P19137 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lama1P19137 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lama1P19137 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lama1P19137 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lama1P19137 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lama1P19137 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lama1P19137 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lama1P19137 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lama1P19137 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lama1P19137 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lama1P19137 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lama1P19137 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Lama1P19137 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Lama1P19137 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lama1P19137 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lama1P19137 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lama1P19137 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lama1P19137 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Lama1P19137 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Lama1P19137 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lama1P19137 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lama1P19137 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lama1P19137 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.4 ms