Protein–RNA interactions for Protein: O54908

Dkk1, Dickkopf-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk1O54908 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Dkk1O54908 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dkk1O54908 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dkk1O54908 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dkk1O54908 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dkk1O54908 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dkk1O54908 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dkk1O54908 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dkk1O54908 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Dkk1O54908 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dkk1O54908 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dkk1O54908 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dkk1O54908 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Dkk1O54908 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dkk1O54908 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dkk1O54908 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dkk1O54908 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dkk1O54908 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dkk1O54908 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dkk1O54908 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dkk1O54908 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dkk1O54908 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dkk1O54908 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dkk1O54908 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dkk1O54908 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dkk1O54908 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dkk1O54908 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dkk1O54908 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dkk1O54908 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dkk1O54908 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dkk1O54908 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dkk1O54908 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dkk1O54908 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dkk1O54908 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dkk1O54908 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dkk1O54908 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dkk1O54908 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dkk1O54908 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dkk1O54908 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dkk1O54908 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dkk1O54908 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dkk1O54908 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dkk1O54908 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dkk1O54908 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dkk1O54908 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dkk1O54908 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dkk1O54908 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dkk1O54908 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dkk1O54908 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dkk1O54908 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dkk1O54908 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dkk1O54908 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dkk1O54908 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dkk1O54908 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dkk1O54908 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dkk1O54908 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dkk1O54908 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dkk1O54908 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Dkk1O54908 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dkk1O54908 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dkk1O54908 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dkk1O54908 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dkk1O54908 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dkk1O54908 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dkk1O54908 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dkk1O54908 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dkk1O54908 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dkk1O54908 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dkk1O54908 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dkk1O54908 Gm20834-202ENSMUST00000185576 1220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dkk1O54908 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dkk1O54908 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Dkk1O54908 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dkk1O54908 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dkk1O54908 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dkk1O54908 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dkk1O54908 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dkk1O54908 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dkk1O54908 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dkk1O54908 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dkk1O54908 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dkk1O54908 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dkk1O54908 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dkk1O54908 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dkk1O54908 AC154828.2-201ENSMUST00000220908 1070 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Dkk1O54908 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dkk1O54908 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dkk1O54908 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dkk1O54908 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dkk1O54908 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dkk1O54908 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dkk1O54908 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dkk1O54908 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dkk1O54908 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dkk1O54908 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dkk1O54908 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dkk1O54908 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dkk1O54908 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dkk1O54908 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dkk1O54908 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms