Protein–RNA interactions for Protein: O35253

Smad7, Mothers against decapentaplegic homolog 7, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad7O35253 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smad7O35253 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smad7O35253 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smad7O35253 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smad7O35253 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smad7O35253 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smad7O35253 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smad7O35253 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smad7O35253 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smad7O35253 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smad7O35253 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smad7O35253 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smad7O35253 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smad7O35253 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smad7O35253 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smad7O35253 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smad7O35253 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smad7O35253 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Smad7O35253 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smad7O35253 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smad7O35253 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smad7O35253 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smad7O35253 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smad7O35253 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Smad7O35253 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smad7O35253 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Smad7O35253 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smad7O35253 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smad7O35253 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smad7O35253 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smad7O35253 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smad7O35253 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smad7O35253 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smad7O35253 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smad7O35253 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smad7O35253 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smad7O35253 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Smad7O35253 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smad7O35253 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smad7O35253 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smad7O35253 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smad7O35253 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smad7O35253 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smad7O35253 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smad7O35253 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smad7O35253 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad7O35253 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad7O35253 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad7O35253 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad7O35253 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad7O35253 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad7O35253 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad7O35253 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad7O35253 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad7O35253 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad7O35253 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad7O35253 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad7O35253 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad7O35253 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad7O35253 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad7O35253 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad7O35253 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad7O35253 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad7O35253 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad7O35253 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad7O35253 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad7O35253 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad7O35253 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad7O35253 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad7O35253 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad7O35253 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad7O35253 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad7O35253 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad7O35253 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad7O35253 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad7O35253 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad7O35253 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad7O35253 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad7O35253 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smad7O35253 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smad7O35253 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smad7O35253 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smad7O35253 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Smad7O35253 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smad7O35253 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smad7O35253 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Smad7O35253 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smad7O35253 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smad7O35253 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smad7O35253 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smad7O35253 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smad7O35253 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smad7O35253 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smad7O35253 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smad7O35253 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smad7O35253 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smad7O35253 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Smad7O35253 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Smad7O35253 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smad7O35253 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms