Protein–RNA interactions for Protein: J3QNS5

Mfsd4b4, Major facilitator superfamily domain-containing 4B4, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4b4J3QNS5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mfsd4b4J3QNS5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mfsd4b4J3QNS5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mfsd4b4J3QNS5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mfsd4b4J3QNS5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Mfsd4b4J3QNS5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mfsd4b4J3QNS5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mfsd4b4J3QNS5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mfsd4b4J3QNS5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mfsd4b4J3QNS5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mfsd4b4J3QNS5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mfsd4b4J3QNS5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mfsd4b4J3QNS5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mfsd4b4J3QNS5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mfsd4b4J3QNS5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mfsd4b4J3QNS5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mfsd4b4J3QNS5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mfsd4b4J3QNS5 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mfsd4b4J3QNS5 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mfsd4b4J3QNS5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mfsd4b4J3QNS5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mfsd4b4J3QNS5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mfsd4b4J3QNS5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mfsd4b4J3QNS5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mfsd4b4J3QNS5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mfsd4b4J3QNS5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mfsd4b4J3QNS5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mfsd4b4J3QNS5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mfsd4b4J3QNS5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mfsd4b4J3QNS5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mfsd4b4J3QNS5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mfsd4b4J3QNS5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mfsd4b4J3QNS5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mfsd4b4J3QNS5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mfsd4b4J3QNS5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mfsd4b4J3QNS5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mfsd4b4J3QNS5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Mfsd4b4J3QNS5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mfsd4b4J3QNS5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mfsd4b4J3QNS5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mfsd4b4J3QNS5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mfsd4b4J3QNS5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mfsd4b4J3QNS5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mfsd4b4J3QNS5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mfsd4b4J3QNS5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mfsd4b4J3QNS5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mfsd4b4J3QNS5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mfsd4b4J3QNS5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mfsd4b4J3QNS5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mfsd4b4J3QNS5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mfsd4b4J3QNS5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mfsd4b4J3QNS5 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mfsd4b4J3QNS5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mfsd4b4J3QNS5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mfsd4b4J3QNS5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mfsd4b4J3QNS5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mfsd4b4J3QNS5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mfsd4b4J3QNS5 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mfsd4b4J3QNS5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mfsd4b4J3QNS5 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mfsd4b4J3QNS5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mfsd4b4J3QNS5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mfsd4b4J3QNS5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mfsd4b4J3QNS5 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mfsd4b4J3QNS5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mfsd4b4J3QNS5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mfsd4b4J3QNS5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mfsd4b4J3QNS5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mfsd4b4J3QNS5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mfsd4b4J3QNS5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mfsd4b4J3QNS5 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Mfsd4b4J3QNS5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mfsd4b4J3QNS5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mfsd4b4J3QNS5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mfsd4b4J3QNS5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mfsd4b4J3QNS5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mfsd4b4J3QNS5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mfsd4b4J3QNS5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mfsd4b4J3QNS5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mfsd4b4J3QNS5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mfsd4b4J3QNS5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Mfsd4b4J3QNS5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mfsd4b4J3QNS5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mfsd4b4J3QNS5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mfsd4b4J3QNS5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mfsd4b4J3QNS5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mfsd4b4J3QNS5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mfsd4b4J3QNS5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mfsd4b4J3QNS5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mfsd4b4J3QNS5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mfsd4b4J3QNS5 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mfsd4b4J3QNS5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mfsd4b4J3QNS5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mfsd4b4J3QNS5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mfsd4b4J3QNS5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mfsd4b4J3QNS5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mfsd4b4J3QNS5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mfsd4b4J3QNS5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mfsd4b4J3QNS5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mfsd4b4J3QNS5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms