Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem200cJ3QK46 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem200cJ3QK46 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem200cJ3QK46 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem200cJ3QK46 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem200cJ3QK46 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem200cJ3QK46 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem200cJ3QK46 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem200cJ3QK46 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem200cJ3QK46 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem200cJ3QK46 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem200cJ3QK46 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem200cJ3QK46 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem200cJ3QK46 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem200cJ3QK46 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem200cJ3QK46 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem200cJ3QK46 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem200cJ3QK46 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem200cJ3QK46 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem200cJ3QK46 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem200cJ3QK46 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem200cJ3QK46 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem200cJ3QK46 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem200cJ3QK46 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem200cJ3QK46 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem200cJ3QK46 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem200cJ3QK46 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem200cJ3QK46 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem200cJ3QK46 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem200cJ3QK46 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem200cJ3QK46 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem200cJ3QK46 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem200cJ3QK46 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem200cJ3QK46 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem200cJ3QK46 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem200cJ3QK46 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem200cJ3QK46 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem200cJ3QK46 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem200cJ3QK46 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem200cJ3QK46 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem200cJ3QK46 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem200cJ3QK46 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem200cJ3QK46 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem200cJ3QK46 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem200cJ3QK46 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem200cJ3QK46 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem200cJ3QK46 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem200cJ3QK46 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem200cJ3QK46 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem200cJ3QK46 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem200cJ3QK46 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem200cJ3QK46 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem200cJ3QK46 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem200cJ3QK46 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem200cJ3QK46 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem200cJ3QK46 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem200cJ3QK46 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem200cJ3QK46 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem200cJ3QK46 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem200cJ3QK46 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem200cJ3QK46 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmem200cJ3QK46 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmem200cJ3QK46 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmem200cJ3QK46 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmem200cJ3QK46 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmem200cJ3QK46 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem200cJ3QK46 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms