Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn34c3J3QJW5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn34c3J3QJW5 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn34c3J3QJW5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn34c3J3QJW5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn34c3J3QJW5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn34c3J3QJW5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn34c3J3QJW5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn34c3J3QJW5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn34c3J3QJW5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn34c3J3QJW5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn34c3J3QJW5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn34c3J3QJW5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn34c3J3QJW5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn34c3J3QJW5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn34c3J3QJW5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn34c3J3QJW5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn34c3J3QJW5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn34c3J3QJW5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn34c3J3QJW5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn34c3J3QJW5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn34c3J3QJW5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn34c3J3QJW5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn34c3J3QJW5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn34c3J3QJW5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn34c3J3QJW5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn34c3J3QJW5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn34c3J3QJW5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn34c3J3QJW5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn34c3J3QJW5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn34c3J3QJW5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn34c3J3QJW5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn34c3J3QJW5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn34c3J3QJW5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn34c3J3QJW5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn34c3J3QJW5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn34c3J3QJW5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn34c3J3QJW5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn34c3J3QJW5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn34c3J3QJW5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn34c3J3QJW5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn34c3J3QJW5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn34c3J3QJW5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn34c3J3QJW5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn34c3J3QJW5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn34c3J3QJW5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn34c3J3QJW5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn34c3J3QJW5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn34c3J3QJW5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn34c3J3QJW5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn34c3J3QJW5 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn34c3J3QJW5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn34c3J3QJW5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn34c3J3QJW5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn34c3J3QJW5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn34c3J3QJW5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn34c3J3QJW5 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn34c3J3QJW5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn34c3J3QJW5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn34c3J3QJW5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn34c3J3QJW5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn34c3J3QJW5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn34c3J3QJW5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn34c3J3QJW5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn34c3J3QJW5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn34c3J3QJW5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn34c3J3QJW5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn34c3J3QJW5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn34c3J3QJW5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn34c3J3QJW5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn34c3J3QJW5 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn34c3J3QJW5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn34c3J3QJW5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn34c3J3QJW5 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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