Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprbB2RU80 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprbB2RU80 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprbB2RU80 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprbB2RU80 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprbB2RU80 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprbB2RU80 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprbB2RU80 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprbB2RU80 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprbB2RU80 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprbB2RU80 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprbB2RU80 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprbB2RU80 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprbB2RU80 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprbB2RU80 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprbB2RU80 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprbB2RU80 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprbB2RU80 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprbB2RU80 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprbB2RU80 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprbB2RU80 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprbB2RU80 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprbB2RU80 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprbB2RU80 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprbB2RU80 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprbB2RU80 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprbB2RU80 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprbB2RU80 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprbB2RU80 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprbB2RU80 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprbB2RU80 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprbB2RU80 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprbB2RU80 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprbB2RU80 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprbB2RU80 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprbB2RU80 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprbB2RU80 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprbB2RU80 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprbB2RU80 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprbB2RU80 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprbB2RU80 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprbB2RU80 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprbB2RU80 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprbB2RU80 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprbB2RU80 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprbB2RU80 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprbB2RU80 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprbB2RU80 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprbB2RU80 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprbB2RU80 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprbB2RU80 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprbB2RU80 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprbB2RU80 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprbB2RU80 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprbB2RU80 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprbB2RU80 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprbB2RU80 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprbB2RU80 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprbB2RU80 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprbB2RU80 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprbB2RU80 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprbB2RU80 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprbB2RU80 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprbB2RU80 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprbB2RU80 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprbB2RU80 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprbB2RU80 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprbB2RU80 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprbB2RU80 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprbB2RU80 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprbB2RU80 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprbB2RU80 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprbB2RU80 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprbB2RU80 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprbB2RU80 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprbB2RU80 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprbB2RU80 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprbB2RU80 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprbB2RU80 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprbB2RU80 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprbB2RU80 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprbB2RU80 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprbB2RU80 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprbB2RU80 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprbB2RU80 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprbB2RU80 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprbB2RU80 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprbB2RU80 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprbB2RU80 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprbB2RU80 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprbB2RU80 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprbB2RU80 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprbB2RU80 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprbB2RU80 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprbB2RU80 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprbB2RU80 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprbB2RU80 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprbB2RU80 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprbB2RU80 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprbB2RU80 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms