Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col9a3A2ACT7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col9a3A2ACT7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col9a3A2ACT7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Col9a3A2ACT7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col9a3A2ACT7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col9a3A2ACT7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col9a3A2ACT7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col9a3A2ACT7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col9a3A2ACT7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col9a3A2ACT7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col9a3A2ACT7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col9a3A2ACT7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col9a3A2ACT7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col9a3A2ACT7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col9a3A2ACT7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col9a3A2ACT7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col9a3A2ACT7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col9a3A2ACT7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col9a3A2ACT7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col9a3A2ACT7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col9a3A2ACT7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col9a3A2ACT7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col9a3A2ACT7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col9a3A2ACT7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col9a3A2ACT7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col9a3A2ACT7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col9a3A2ACT7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col9a3A2ACT7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col9a3A2ACT7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col9a3A2ACT7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Col9a3A2ACT7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col9a3A2ACT7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col9a3A2ACT7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col9a3A2ACT7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col9a3A2ACT7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col9a3A2ACT7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col9a3A2ACT7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col9a3A2ACT7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col9a3A2ACT7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col9a3A2ACT7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Col9a3A2ACT7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col9a3A2ACT7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col9a3A2ACT7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Col9a3A2ACT7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col9a3A2ACT7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col9a3A2ACT7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col9a3A2ACT7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col9a3A2ACT7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col9a3A2ACT7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col9a3A2ACT7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col9a3A2ACT7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col9a3A2ACT7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Col9a3A2ACT7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col9a3A2ACT7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col9a3A2ACT7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col9a3A2ACT7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col9a3A2ACT7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col9a3A2ACT7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col9a3A2ACT7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col9a3A2ACT7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col9a3A2ACT7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col9a3A2ACT7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col9a3A2ACT7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col9a3A2ACT7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col9a3A2ACT7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col9a3A2ACT7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col9a3A2ACT7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col9a3A2ACT7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col9a3A2ACT7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col9a3A2ACT7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col9a3A2ACT7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col9a3A2ACT7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col9a3A2ACT7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Col9a3A2ACT7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Col9a3A2ACT7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Col9a3A2ACT7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Col9a3A2ACT7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Col9a3A2ACT7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Col9a3A2ACT7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Col9a3A2ACT7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Col9a3A2ACT7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Col9a3A2ACT7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Col9a3A2ACT7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Col9a3A2ACT7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Col9a3A2ACT7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Col9a3A2ACT7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Col9a3A2ACT7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Col9a3A2ACT7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Col9a3A2ACT7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Col9a3A2ACT7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Col9a3A2ACT7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Col9a3A2ACT7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Col9a3A2ACT7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Col9a3A2ACT7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Col9a3A2ACT7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Col9a3A2ACT7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Col9a3A2ACT7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Col9a3A2ACT7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Col9a3A2ACT7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms