Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Trpv2Q9WTR1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trpv2Q9WTR1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trpv2Q9WTR1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trpv2Q9WTR1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trpv2Q9WTR1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trpv2Q9WTR1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trpv2Q9WTR1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trpv2Q9WTR1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trpv2Q9WTR1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trpv2Q9WTR1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trpv2Q9WTR1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trpv2Q9WTR1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trpv2Q9WTR1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trpv2Q9WTR1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Trpv2Q9WTR1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trpv2Q9WTR1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trpv2Q9WTR1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Trpv2Q9WTR1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpv2Q9WTR1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpv2Q9WTR1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpv2Q9WTR1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpv2Q9WTR1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpv2Q9WTR1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpv2Q9WTR1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpv2Q9WTR1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpv2Q9WTR1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpv2Q9WTR1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trpv2Q9WTR1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trpv2Q9WTR1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trpv2Q9WTR1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trpv2Q9WTR1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trpv2Q9WTR1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trpv2Q9WTR1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Trpv2Q9WTR1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trpv2Q9WTR1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trpv2Q9WTR1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trpv2Q9WTR1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trpv2Q9WTR1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trpv2Q9WTR1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trpv2Q9WTR1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trpv2Q9WTR1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trpv2Q9WTR1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpv2Q9WTR1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpv2Q9WTR1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpv2Q9WTR1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpv2Q9WTR1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpv2Q9WTR1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpv2Q9WTR1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpv2Q9WTR1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpv2Q9WTR1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpv2Q9WTR1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpv2Q9WTR1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpv2Q9WTR1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpv2Q9WTR1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpv2Q9WTR1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trpv2Q9WTR1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trpv2Q9WTR1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trpv2Q9WTR1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trpv2Q9WTR1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trpv2Q9WTR1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trpv2Q9WTR1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trpv2Q9WTR1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trpv2Q9WTR1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trpv2Q9WTR1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trpv2Q9WTR1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trpv2Q9WTR1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trpv2Q9WTR1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpv2Q9WTR1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpv2Q9WTR1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpv2Q9WTR1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpv2Q9WTR1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpv2Q9WTR1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpv2Q9WTR1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpv2Q9WTR1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpv2Q9WTR1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpv2Q9WTR1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trpv2Q9WTR1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trpv2Q9WTR1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trpv2Q9WTR1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trpv2Q9WTR1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trpv2Q9WTR1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trpv2Q9WTR1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trpv2Q9WTR1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trpv2Q9WTR1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpv2Q9WTR1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpv2Q9WTR1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpv2Q9WTR1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpv2Q9WTR1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpv2Q9WTR1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpv2Q9WTR1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpv2Q9WTR1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpv2Q9WTR1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpv2Q9WTR1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpv2Q9WTR1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpv2Q9WTR1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpv2Q9WTR1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpv2Q9WTR1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpv2Q9WTR1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpv2Q9WTR1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms