Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0N8

Syt6, Synaptotagmin-6, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt6Q9R0N8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syt6Q9R0N8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syt6Q9R0N8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syt6Q9R0N8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syt6Q9R0N8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syt6Q9R0N8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syt6Q9R0N8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syt6Q9R0N8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syt6Q9R0N8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syt6Q9R0N8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syt6Q9R0N8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syt6Q9R0N8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syt6Q9R0N8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syt6Q9R0N8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syt6Q9R0N8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syt6Q9R0N8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syt6Q9R0N8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syt6Q9R0N8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syt6Q9R0N8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syt6Q9R0N8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syt6Q9R0N8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syt6Q9R0N8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syt6Q9R0N8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syt6Q9R0N8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syt6Q9R0N8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syt6Q9R0N8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syt6Q9R0N8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syt6Q9R0N8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syt6Q9R0N8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syt6Q9R0N8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syt6Q9R0N8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syt6Q9R0N8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syt6Q9R0N8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syt6Q9R0N8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syt6Q9R0N8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syt6Q9R0N8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syt6Q9R0N8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syt6Q9R0N8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syt6Q9R0N8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syt6Q9R0N8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syt6Q9R0N8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syt6Q9R0N8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syt6Q9R0N8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syt6Q9R0N8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syt6Q9R0N8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syt6Q9R0N8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syt6Q9R0N8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syt6Q9R0N8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syt6Q9R0N8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syt6Q9R0N8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Syt6Q9R0N8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syt6Q9R0N8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syt6Q9R0N8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syt6Q9R0N8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syt6Q9R0N8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syt6Q9R0N8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syt6Q9R0N8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syt6Q9R0N8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syt6Q9R0N8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syt6Q9R0N8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syt6Q9R0N8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Syt6Q9R0N8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syt6Q9R0N8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Syt6Q9R0N8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Syt6Q9R0N8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Syt6Q9R0N8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syt6Q9R0N8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syt6Q9R0N8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syt6Q9R0N8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syt6Q9R0N8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syt6Q9R0N8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syt6Q9R0N8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syt6Q9R0N8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syt6Q9R0N8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syt6Q9R0N8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syt6Q9R0N8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syt6Q9R0N8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Syt6Q9R0N8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syt6Q9R0N8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syt6Q9R0N8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syt6Q9R0N8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syt6Q9R0N8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Syt6Q9R0N8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syt6Q9R0N8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syt6Q9R0N8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syt6Q9R0N8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syt6Q9R0N8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syt6Q9R0N8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syt6Q9R0N8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syt6Q9R0N8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syt6Q9R0N8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syt6Q9R0N8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syt6Q9R0N8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syt6Q9R0N8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Syt6Q9R0N8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Syt6Q9R0N8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Syt6Q9R0N8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syt6Q9R0N8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syt6Q9R0N8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syt6Q9R0N8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms