Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS3

Smco4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco4Q9JIS3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smco4Q9JIS3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smco4Q9JIS3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smco4Q9JIS3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smco4Q9JIS3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smco4Q9JIS3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smco4Q9JIS3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smco4Q9JIS3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smco4Q9JIS3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smco4Q9JIS3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smco4Q9JIS3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smco4Q9JIS3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smco4Q9JIS3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smco4Q9JIS3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Smco4Q9JIS3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smco4Q9JIS3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smco4Q9JIS3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smco4Q9JIS3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smco4Q9JIS3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smco4Q9JIS3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smco4Q9JIS3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smco4Q9JIS3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smco4Q9JIS3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Smco4Q9JIS3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smco4Q9JIS3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smco4Q9JIS3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smco4Q9JIS3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smco4Q9JIS3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smco4Q9JIS3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smco4Q9JIS3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smco4Q9JIS3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smco4Q9JIS3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smco4Q9JIS3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smco4Q9JIS3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smco4Q9JIS3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smco4Q9JIS3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smco4Q9JIS3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smco4Q9JIS3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smco4Q9JIS3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smco4Q9JIS3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smco4Q9JIS3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smco4Q9JIS3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smco4Q9JIS3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smco4Q9JIS3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smco4Q9JIS3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smco4Q9JIS3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smco4Q9JIS3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smco4Q9JIS3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smco4Q9JIS3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smco4Q9JIS3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smco4Q9JIS3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smco4Q9JIS3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smco4Q9JIS3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smco4Q9JIS3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smco4Q9JIS3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smco4Q9JIS3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smco4Q9JIS3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smco4Q9JIS3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smco4Q9JIS3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smco4Q9JIS3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smco4Q9JIS3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smco4Q9JIS3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smco4Q9JIS3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smco4Q9JIS3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smco4Q9JIS3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smco4Q9JIS3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smco4Q9JIS3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smco4Q9JIS3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smco4Q9JIS3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smco4Q9JIS3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smco4Q9JIS3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms