Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC16

Ergic1, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic1Q9DC16 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ergic1Q9DC16 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ergic1Q9DC16 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ergic1Q9DC16 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ergic1Q9DC16 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms