Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y1

Ccdc3, Coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc3Q9D6Y1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc3Q9D6Y1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc3Q9D6Y1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc3Q9D6Y1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc3Q9D6Y1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc3Q9D6Y1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc3Q9D6Y1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc3Q9D6Y1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc3Q9D6Y1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc3Q9D6Y1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc3Q9D6Y1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc3Q9D6Y1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc3Q9D6Y1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc3Q9D6Y1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc3Q9D6Y1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc3Q9D6Y1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc3Q9D6Y1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc3Q9D6Y1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc3Q9D6Y1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc3Q9D6Y1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc3Q9D6Y1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc3Q9D6Y1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc3Q9D6Y1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc3Q9D6Y1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc3Q9D6Y1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc3Q9D6Y1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc3Q9D6Y1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc3Q9D6Y1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc3Q9D6Y1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc3Q9D6Y1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc3Q9D6Y1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc3Q9D6Y1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc3Q9D6Y1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc3Q9D6Y1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc3Q9D6Y1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc3Q9D6Y1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc3Q9D6Y1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc3Q9D6Y1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc3Q9D6Y1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc3Q9D6Y1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc3Q9D6Y1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc3Q9D6Y1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc3Q9D6Y1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc3Q9D6Y1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc3Q9D6Y1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc3Q9D6Y1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc3Q9D6Y1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc3Q9D6Y1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc3Q9D6Y1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc3Q9D6Y1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc3Q9D6Y1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc3Q9D6Y1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc3Q9D6Y1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc3Q9D6Y1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc3Q9D6Y1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc3Q9D6Y1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc3Q9D6Y1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc3Q9D6Y1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc3Q9D6Y1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc3Q9D6Y1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc3Q9D6Y1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc3Q9D6Y1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc3Q9D6Y1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc3Q9D6Y1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc3Q9D6Y1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc3Q9D6Y1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc3Q9D6Y1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc3Q9D6Y1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc3Q9D6Y1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc3Q9D6Y1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc3Q9D6Y1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc3Q9D6Y1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc3Q9D6Y1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc3Q9D6Y1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc3Q9D6Y1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc3Q9D6Y1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc3Q9D6Y1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc3Q9D6Y1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc3Q9D6Y1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc3Q9D6Y1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc3Q9D6Y1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc3Q9D6Y1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc3Q9D6Y1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc3Q9D6Y1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc3Q9D6Y1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc3Q9D6Y1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc3Q9D6Y1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc3Q9D6Y1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc3Q9D6Y1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc3Q9D6Y1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc3Q9D6Y1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc3Q9D6Y1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc3Q9D6Y1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc3Q9D6Y1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc3Q9D6Y1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc3Q9D6Y1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc3Q9D6Y1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc3Q9D6Y1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc3Q9D6Y1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc3Q9D6Y1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms