Protein–RNA interactions for Protein: Q91VU1

Yipf1, Protein YIPF1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf1Q91VU1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Yipf1Q91VU1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Yipf1Q91VU1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Yipf1Q91VU1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Yipf1Q91VU1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Yipf1Q91VU1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Yipf1Q91VU1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Yipf1Q91VU1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Yipf1Q91VU1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Yipf1Q91VU1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Yipf1Q91VU1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Yipf1Q91VU1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Yipf1Q91VU1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Yipf1Q91VU1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Yipf1Q91VU1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Yipf1Q91VU1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Yipf1Q91VU1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Yipf1Q91VU1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Yipf1Q91VU1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Yipf1Q91VU1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Yipf1Q91VU1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Yipf1Q91VU1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Yipf1Q91VU1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Yipf1Q91VU1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Yipf1Q91VU1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Yipf1Q91VU1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Yipf1Q91VU1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Yipf1Q91VU1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Yipf1Q91VU1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Yipf1Q91VU1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Yipf1Q91VU1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Yipf1Q91VU1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Yipf1Q91VU1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Yipf1Q91VU1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Yipf1Q91VU1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Yipf1Q91VU1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Yipf1Q91VU1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Yipf1Q91VU1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Yipf1Q91VU1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Yipf1Q91VU1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Yipf1Q91VU1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Yipf1Q91VU1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Yipf1Q91VU1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Yipf1Q91VU1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Yipf1Q91VU1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Yipf1Q91VU1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Yipf1Q91VU1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Yipf1Q91VU1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Yipf1Q91VU1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Yipf1Q91VU1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Yipf1Q91VU1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Yipf1Q91VU1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Yipf1Q91VU1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Yipf1Q91VU1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Yipf1Q91VU1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Yipf1Q91VU1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Yipf1Q91VU1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Yipf1Q91VU1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Yipf1Q91VU1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Yipf1Q91VU1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Yipf1Q91VU1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Yipf1Q91VU1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Yipf1Q91VU1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Yipf1Q91VU1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Yipf1Q91VU1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Yipf1Q91VU1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Yipf1Q91VU1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Yipf1Q91VU1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Yipf1Q91VU1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Yipf1Q91VU1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Yipf1Q91VU1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Yipf1Q91VU1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Yipf1Q91VU1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Yipf1Q91VU1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Yipf1Q91VU1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Yipf1Q91VU1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Yipf1Q91VU1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Yipf1Q91VU1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Yipf1Q91VU1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Yipf1Q91VU1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Yipf1Q91VU1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Yipf1Q91VU1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Yipf1Q91VU1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Yipf1Q91VU1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Yipf1Q91VU1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Yipf1Q91VU1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Yipf1Q91VU1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Yipf1Q91VU1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Yipf1Q91VU1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Yipf1Q91VU1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Yipf1Q91VU1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Yipf1Q91VU1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Yipf1Q91VU1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Yipf1Q91VU1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Yipf1Q91VU1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Yipf1Q91VU1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Yipf1Q91VU1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Yipf1Q91VU1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Yipf1Q91VU1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Yipf1Q91VU1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms