Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam20bQ8VCS3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam20bQ8VCS3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam20bQ8VCS3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam20bQ8VCS3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam20bQ8VCS3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam20bQ8VCS3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam20bQ8VCS3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam20bQ8VCS3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam20bQ8VCS3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam20bQ8VCS3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam20bQ8VCS3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam20bQ8VCS3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam20bQ8VCS3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam20bQ8VCS3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam20bQ8VCS3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam20bQ8VCS3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam20bQ8VCS3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam20bQ8VCS3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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