Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIS0

Card11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Card11Q8CIS0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Card11Q8CIS0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Card11Q8CIS0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Card11Q8CIS0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Card11Q8CIS0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Card11Q8CIS0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Card11Q8CIS0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Card11Q8CIS0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Card11Q8CIS0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Card11Q8CIS0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Card11Q8CIS0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Card11Q8CIS0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Card11Q8CIS0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Card11Q8CIS0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Card11Q8CIS0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Card11Q8CIS0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Card11Q8CIS0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Card11Q8CIS0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Card11Q8CIS0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Card11Q8CIS0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Card11Q8CIS0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Card11Q8CIS0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Card11Q8CIS0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Card11Q8CIS0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Card11Q8CIS0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Card11Q8CIS0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Card11Q8CIS0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Card11Q8CIS0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Card11Q8CIS0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Card11Q8CIS0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Card11Q8CIS0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Card11Q8CIS0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Card11Q8CIS0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Card11Q8CIS0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Card11Q8CIS0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Card11Q8CIS0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Card11Q8CIS0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Card11Q8CIS0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Card11Q8CIS0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Card11Q8CIS0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Card11Q8CIS0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Card11Q8CIS0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Card11Q8CIS0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Card11Q8CIS0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Card11Q8CIS0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Card11Q8CIS0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Card11Q8CIS0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Card11Q8CIS0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Card11Q8CIS0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Card11Q8CIS0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Card11Q8CIS0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Card11Q8CIS0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Card11Q8CIS0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Card11Q8CIS0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Card11Q8CIS0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Card11Q8CIS0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Card11Q8CIS0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Card11Q8CIS0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Card11Q8CIS0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Card11Q8CIS0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Card11Q8CIS0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Card11Q8CIS0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Card11Q8CIS0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Card11Q8CIS0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Card11Q8CIS0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Card11Q8CIS0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Card11Q8CIS0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Card11Q8CIS0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Card11Q8CIS0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Card11Q8CIS0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Card11Q8CIS0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Card11Q8CIS0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Card11Q8CIS0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Card11Q8CIS0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Card11Q8CIS0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Card11Q8CIS0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Card11Q8CIS0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Card11Q8CIS0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Card11Q8CIS0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Card11Q8CIS0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Card11Q8CIS0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Card11Q8CIS0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Card11Q8CIS0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Card11Q8CIS0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Card11Q8CIS0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Card11Q8CIS0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Card11Q8CIS0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Card11Q8CIS0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Card11Q8CIS0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Card11Q8CIS0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Card11Q8CIS0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Card11Q8CIS0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Card11Q8CIS0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Card11Q8CIS0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Card11Q8CIS0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Card11Q8CIS0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Card11Q8CIS0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Card11Q8CIS0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Card11Q8CIS0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Card11Q8CIS0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms