Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCE9

E4f1, Transcription factor E4F1, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4f1Q8CCE9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
E4f1Q8CCE9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
E4f1Q8CCE9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
E4f1Q8CCE9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
E4f1Q8CCE9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
E4f1Q8CCE9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
E4f1Q8CCE9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
E4f1Q8CCE9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
E4f1Q8CCE9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
E4f1Q8CCE9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
E4f1Q8CCE9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
E4f1Q8CCE9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
E4f1Q8CCE9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
E4f1Q8CCE9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E4f1Q8CCE9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E4f1Q8CCE9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E4f1Q8CCE9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E4f1Q8CCE9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E4f1Q8CCE9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E4f1Q8CCE9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
E4f1Q8CCE9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E4f1Q8CCE9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
E4f1Q8CCE9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
E4f1Q8CCE9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E4f1Q8CCE9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
E4f1Q8CCE9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E4f1Q8CCE9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
E4f1Q8CCE9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E4f1Q8CCE9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E4f1Q8CCE9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
E4f1Q8CCE9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E4f1Q8CCE9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E4f1Q8CCE9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E4f1Q8CCE9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E4f1Q8CCE9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E4f1Q8CCE9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E4f1Q8CCE9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E4f1Q8CCE9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
E4f1Q8CCE9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
E4f1Q8CCE9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
E4f1Q8CCE9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
E4f1Q8CCE9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
E4f1Q8CCE9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
E4f1Q8CCE9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
E4f1Q8CCE9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
E4f1Q8CCE9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
E4f1Q8CCE9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
E4f1Q8CCE9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
E4f1Q8CCE9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
E4f1Q8CCE9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
E4f1Q8CCE9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
E4f1Q8CCE9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
E4f1Q8CCE9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
E4f1Q8CCE9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
E4f1Q8CCE9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
E4f1Q8CCE9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
E4f1Q8CCE9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
E4f1Q8CCE9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
E4f1Q8CCE9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
E4f1Q8CCE9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
E4f1Q8CCE9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
E4f1Q8CCE9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
E4f1Q8CCE9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
E4f1Q8CCE9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
E4f1Q8CCE9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
E4f1Q8CCE9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
E4f1Q8CCE9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
E4f1Q8CCE9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
E4f1Q8CCE9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
E4f1Q8CCE9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
E4f1Q8CCE9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
E4f1Q8CCE9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
E4f1Q8CCE9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
E4f1Q8CCE9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
E4f1Q8CCE9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
E4f1Q8CCE9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
E4f1Q8CCE9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
E4f1Q8CCE9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
E4f1Q8CCE9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
E4f1Q8CCE9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
E4f1Q8CCE9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
E4f1Q8CCE9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
E4f1Q8CCE9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
E4f1Q8CCE9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
E4f1Q8CCE9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
E4f1Q8CCE9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
E4f1Q8CCE9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
E4f1Q8CCE9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
E4f1Q8CCE9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
E4f1Q8CCE9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
E4f1Q8CCE9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
E4f1Q8CCE9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
E4f1Q8CCE9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
E4f1Q8CCE9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
E4f1Q8CCE9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
E4f1Q8CCE9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
E4f1Q8CCE9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
E4f1Q8CCE9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
E4f1Q8CCE9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
E4f1Q8CCE9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms