Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Pdcl3Q8BVF2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdcl3Q8BVF2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdcl3Q8BVF2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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Pdcl3Q8BVF2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdcl3Q8BVF2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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Pdcl3Q8BVF2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdcl3Q8BVF2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdcl3Q8BVF2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdcl3Q8BVF2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdcl3Q8BVF2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdcl3Q8BVF2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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Pdcl3Q8BVF2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdcl3Q8BVF2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdcl3Q8BVF2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdcl3Q8BVF2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdcl3Q8BVF2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdcl3Q8BVF2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdcl3Q8BVF2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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Pdcl3Q8BVF2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdcl3Q8BVF2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdcl3Q8BVF2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdcl3Q8BVF2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdcl3Q8BVF2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdcl3Q8BVF2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdcl3Q8BVF2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdcl3Q8BVF2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdcl3Q8BVF2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdcl3Q8BVF2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdcl3Q8BVF2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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Pdcl3Q8BVF2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Pdcl3Q8BVF2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Pdcl3Q8BVF2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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Pdcl3Q8BVF2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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Pdcl3Q8BVF2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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Pdcl3Q8BVF2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Pdcl3Q8BVF2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdcl3Q8BVF2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdcl3Q8BVF2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Pdcl3Q8BVF2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdcl3Q8BVF2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdcl3Q8BVF2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdcl3Q8BVF2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdcl3Q8BVF2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdcl3Q8BVF2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdcl3Q8BVF2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdcl3Q8BVF2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdcl3Q8BVF2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdcl3Q8BVF2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdcl3Q8BVF2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdcl3Q8BVF2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdcl3Q8BVF2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdcl3Q8BVF2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms