Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Grik4Q8BMF5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Grik4Q8BMF5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Grik4Q8BMF5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Grik4Q8BMF5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Grik4Q8BMF5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Grik4Q8BMF5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grik4Q8BMF5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grik4Q8BMF5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grik4Q8BMF5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grik4Q8BMF5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Grik4Q8BMF5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grik4Q8BMF5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Grik4Q8BMF5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Grik4Q8BMF5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grik4Q8BMF5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grik4Q8BMF5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grik4Q8BMF5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grik4Q8BMF5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grik4Q8BMF5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grik4Q8BMF5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grik4Q8BMF5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grik4Q8BMF5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grik4Q8BMF5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grik4Q8BMF5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Grik4Q8BMF5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Grik4Q8BMF5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Grik4Q8BMF5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Grik4Q8BMF5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Grik4Q8BMF5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Grik4Q8BMF5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Grik4Q8BMF5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Grik4Q8BMF5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Grik4Q8BMF5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Grik4Q8BMF5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Grik4Q8BMF5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Grik4Q8BMF5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Grik4Q8BMF5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Grik4Q8BMF5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Grik4Q8BMF5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Grik4Q8BMF5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Grik4Q8BMF5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Grik4Q8BMF5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Grik4Q8BMF5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Grik4Q8BMF5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Grik4Q8BMF5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Grik4Q8BMF5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Grik4Q8BMF5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Grik4Q8BMF5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Grik4Q8BMF5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Grik4Q8BMF5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Grik4Q8BMF5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Grik4Q8BMF5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Grik4Q8BMF5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Grik4Q8BMF5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Grik4Q8BMF5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Grik4Q8BMF5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Grik4Q8BMF5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Grik4Q8BMF5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Grik4Q8BMF5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Grik4Q8BMF5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Grik4Q8BMF5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Grik4Q8BMF5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Grik4Q8BMF5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Grik4Q8BMF5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Grik4Q8BMF5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Grik4Q8BMF5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Grik4Q8BMF5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Grik4Q8BMF5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Grik4Q8BMF5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Grik4Q8BMF5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Grik4Q8BMF5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Grik4Q8BMF5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Grik4Q8BMF5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Grik4Q8BMF5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Grik4Q8BMF5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Grik4Q8BMF5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Grik4Q8BMF5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Grik4Q8BMF5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Grik4Q8BMF5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Grik4Q8BMF5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Grik4Q8BMF5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Grik4Q8BMF5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Grik4Q8BMF5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Grik4Q8BMF5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Grik4Q8BMF5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Grik4Q8BMF5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Grik4Q8BMF5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Grik4Q8BMF5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Grik4Q8BMF5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Grik4Q8BMF5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Grik4Q8BMF5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Grik4Q8BMF5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Grik4Q8BMF5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Grik4Q8BMF5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Grik4Q8BMF5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Grik4Q8BMF5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Grik4Q8BMF5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Grik4Q8BMF5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Grik4Q8BMF5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms