Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZU6

Thsd7a, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7A, mousemouse

Predictions only

Length 1,645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd7aQ69ZU6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Thsd7aQ69ZU6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Thsd7aQ69ZU6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Thsd7aQ69ZU6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Thsd7aQ69ZU6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Thsd7aQ69ZU6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Thsd7aQ69ZU6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Thsd7aQ69ZU6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Thsd7aQ69ZU6 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Thsd7aQ69ZU6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Thsd7aQ69ZU6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Thsd7aQ69ZU6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Thsd7aQ69ZU6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Thsd7aQ69ZU6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Thsd7aQ69ZU6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Thsd7aQ69ZU6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Thsd7aQ69ZU6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Thsd7aQ69ZU6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Thsd7aQ69ZU6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Thsd7aQ69ZU6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Thsd7aQ69ZU6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Thsd7aQ69ZU6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Thsd7aQ69ZU6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Thsd7aQ69ZU6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
Thsd7aQ69ZU6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Thsd7aQ69ZU6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Thsd7aQ69ZU6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Thsd7aQ69ZU6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Thsd7aQ69ZU6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Thsd7aQ69ZU6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Thsd7aQ69ZU6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Thsd7aQ69ZU6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Thsd7aQ69ZU6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Thsd7aQ69ZU6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Thsd7aQ69ZU6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Thsd7aQ69ZU6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Thsd7aQ69ZU6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Thsd7aQ69ZU6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Thsd7aQ69ZU6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Thsd7aQ69ZU6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Thsd7aQ69ZU6 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Thsd7aQ69ZU6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Thsd7aQ69ZU6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Thsd7aQ69ZU6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Thsd7aQ69ZU6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Thsd7aQ69ZU6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Thsd7aQ69ZU6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Thsd7aQ69ZU6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Thsd7aQ69ZU6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Thsd7aQ69ZU6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Thsd7aQ69ZU6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Thsd7aQ69ZU6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Thsd7aQ69ZU6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Thsd7aQ69ZU6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Thsd7aQ69ZU6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Thsd7aQ69ZU6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Thsd7aQ69ZU6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Thsd7aQ69ZU6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Thsd7aQ69ZU6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Thsd7aQ69ZU6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Thsd7aQ69ZU6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Thsd7aQ69ZU6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Thsd7aQ69ZU6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Thsd7aQ69ZU6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Thsd7aQ69ZU6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Thsd7aQ69ZU6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Thsd7aQ69ZU6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Thsd7aQ69ZU6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Thsd7aQ69ZU6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Thsd7aQ69ZU6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Thsd7aQ69ZU6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Thsd7aQ69ZU6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Thsd7aQ69ZU6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Thsd7aQ69ZU6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Thsd7aQ69ZU6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Thsd7aQ69ZU6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Thsd7aQ69ZU6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Thsd7aQ69ZU6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Thsd7aQ69ZU6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Thsd7aQ69ZU6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Thsd7aQ69ZU6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Thsd7aQ69ZU6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Thsd7aQ69ZU6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Thsd7aQ69ZU6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Thsd7aQ69ZU6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Thsd7aQ69ZU6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Thsd7aQ69ZU6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Thsd7aQ69ZU6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Thsd7aQ69ZU6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Thsd7aQ69ZU6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Thsd7aQ69ZU6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Thsd7aQ69ZU6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Thsd7aQ69ZU6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Thsd7aQ69ZU6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Thsd7aQ69ZU6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Thsd7aQ69ZU6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Thsd7aQ69ZU6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Thsd7aQ69ZU6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Thsd7aQ69ZU6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Thsd7aQ69ZU6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms