Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atg9aQ68FE2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atg9aQ68FE2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atg9aQ68FE2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atg9aQ68FE2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atg9aQ68FE2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atg9aQ68FE2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atg9aQ68FE2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atg9aQ68FE2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atg9aQ68FE2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atg9aQ68FE2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Atg9aQ68FE2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atg9aQ68FE2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atg9aQ68FE2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atg9aQ68FE2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atg9aQ68FE2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atg9aQ68FE2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atg9aQ68FE2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atg9aQ68FE2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Atg9aQ68FE2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atg9aQ68FE2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atg9aQ68FE2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Atg9aQ68FE2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atg9aQ68FE2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atg9aQ68FE2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atg9aQ68FE2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atg9aQ68FE2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atg9aQ68FE2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atg9aQ68FE2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atg9aQ68FE2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atg9aQ68FE2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Atg9aQ68FE2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atg9aQ68FE2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atg9aQ68FE2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Atg9aQ68FE2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atg9aQ68FE2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atg9aQ68FE2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atg9aQ68FE2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atg9aQ68FE2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atg9aQ68FE2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Atg9aQ68FE2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Atg9aQ68FE2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atg9aQ68FE2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Atg9aQ68FE2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atg9aQ68FE2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atg9aQ68FE2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atg9aQ68FE2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atg9aQ68FE2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atg9aQ68FE2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atg9aQ68FE2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atg9aQ68FE2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atg9aQ68FE2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atg9aQ68FE2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atg9aQ68FE2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atg9aQ68FE2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atg9aQ68FE2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atg9aQ68FE2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atg9aQ68FE2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atg9aQ68FE2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atg9aQ68FE2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Atg9aQ68FE2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atg9aQ68FE2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Atg9aQ68FE2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atg9aQ68FE2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atg9aQ68FE2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atg9aQ68FE2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atg9aQ68FE2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atg9aQ68FE2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atg9aQ68FE2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atg9aQ68FE2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atg9aQ68FE2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atg9aQ68FE2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Atg9aQ68FE2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atg9aQ68FE2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atg9aQ68FE2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atg9aQ68FE2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atg9aQ68FE2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atg9aQ68FE2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atg9aQ68FE2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atg9aQ68FE2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atg9aQ68FE2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atg9aQ68FE2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atg9aQ68FE2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atg9aQ68FE2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atg9aQ68FE2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atg9aQ68FE2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atg9aQ68FE2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atg9aQ68FE2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atg9aQ68FE2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atg9aQ68FE2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atg9aQ68FE2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atg9aQ68FE2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atg9aQ68FE2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atg9aQ68FE2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atg9aQ68FE2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atg9aQ68FE2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atg9aQ68FE2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atg9aQ68FE2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atg9aQ68FE2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atg9aQ68FE2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms