Protein–RNA interactions for Protein: Q60753

Ctf1, Cardiotrophin-1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctf1Q60753 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctf1Q60753 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctf1Q60753 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctf1Q60753 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctf1Q60753 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctf1Q60753 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctf1Q60753 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctf1Q60753 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctf1Q60753 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctf1Q60753 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctf1Q60753 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctf1Q60753 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctf1Q60753 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctf1Q60753 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctf1Q60753 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctf1Q60753 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctf1Q60753 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctf1Q60753 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctf1Q60753 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctf1Q60753 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctf1Q60753 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctf1Q60753 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctf1Q60753 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctf1Q60753 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctf1Q60753 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctf1Q60753 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctf1Q60753 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctf1Q60753 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctf1Q60753 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctf1Q60753 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctf1Q60753 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctf1Q60753 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctf1Q60753 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctf1Q60753 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctf1Q60753 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctf1Q60753 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctf1Q60753 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctf1Q60753 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctf1Q60753 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctf1Q60753 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctf1Q60753 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctf1Q60753 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctf1Q60753 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctf1Q60753 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctf1Q60753 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctf1Q60753 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctf1Q60753 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctf1Q60753 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctf1Q60753 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctf1Q60753 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctf1Q60753 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctf1Q60753 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctf1Q60753 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctf1Q60753 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctf1Q60753 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctf1Q60753 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctf1Q60753 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctf1Q60753 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctf1Q60753 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctf1Q60753 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctf1Q60753 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctf1Q60753 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctf1Q60753 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctf1Q60753 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctf1Q60753 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctf1Q60753 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctf1Q60753 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctf1Q60753 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctf1Q60753 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms