Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVP0

9930111J21Rik1, RIKEN cDNA 9930111J21 gene 1, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930111J21Rik1Q5SVP0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
9930111J21Rik1Q5SVP0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
9930111J21Rik1Q5SVP0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
9930111J21Rik1Q5SVP0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
9930111J21Rik1Q5SVP0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
9930111J21Rik1Q5SVP0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
9930111J21Rik1Q5SVP0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
9930111J21Rik1Q5SVP0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
9930111J21Rik1Q5SVP0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
9930111J21Rik1Q5SVP0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
9930111J21Rik1Q5SVP0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
9930111J21Rik1Q5SVP0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
9930111J21Rik1Q5SVP0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
9930111J21Rik1Q5SVP0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
9930111J21Rik1Q5SVP0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
9930111J21Rik1Q5SVP0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
9930111J21Rik1Q5SVP0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
9930111J21Rik1Q5SVP0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
9930111J21Rik1Q5SVP0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
9930111J21Rik1Q5SVP0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
9930111J21Rik1Q5SVP0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
9930111J21Rik1Q5SVP0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
9930111J21Rik1Q5SVP0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
9930111J21Rik1Q5SVP0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
9930111J21Rik1Q5SVP0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
9930111J21Rik1Q5SVP0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
9930111J21Rik1Q5SVP0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
9930111J21Rik1Q5SVP0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
9930111J21Rik1Q5SVP0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
9930111J21Rik1Q5SVP0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
9930111J21Rik1Q5SVP0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
9930111J21Rik1Q5SVP0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
9930111J21Rik1Q5SVP0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
9930111J21Rik1Q5SVP0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
9930111J21Rik1Q5SVP0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
9930111J21Rik1Q5SVP0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
9930111J21Rik1Q5SVP0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
9930111J21Rik1Q5SVP0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
9930111J21Rik1Q5SVP0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
9930111J21Rik1Q5SVP0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
9930111J21Rik1Q5SVP0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.8 ms