Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJS3

Fam20c, Extracellular serine/threonine protein kinase FAM20C, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20cQ5MJS3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fam20cQ5MJS3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fam20cQ5MJS3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fam20cQ5MJS3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fam20cQ5MJS3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fam20cQ5MJS3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fam20cQ5MJS3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fam20cQ5MJS3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fam20cQ5MJS3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fam20cQ5MJS3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fam20cQ5MJS3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fam20cQ5MJS3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fam20cQ5MJS3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fam20cQ5MJS3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fam20cQ5MJS3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fam20cQ5MJS3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fam20cQ5MJS3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fam20cQ5MJS3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam20cQ5MJS3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam20cQ5MJS3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam20cQ5MJS3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam20cQ5MJS3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam20cQ5MJS3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam20cQ5MJS3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam20cQ5MJS3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam20cQ5MJS3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam20cQ5MJS3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam20cQ5MJS3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam20cQ5MJS3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam20cQ5MJS3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam20cQ5MJS3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam20cQ5MJS3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam20cQ5MJS3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam20cQ5MJS3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam20cQ5MJS3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam20cQ5MJS3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam20cQ5MJS3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam20cQ5MJS3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam20cQ5MJS3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam20cQ5MJS3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam20cQ5MJS3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam20cQ5MJS3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam20cQ5MJS3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam20cQ5MJS3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam20cQ5MJS3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam20cQ5MJS3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam20cQ5MJS3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam20cQ5MJS3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam20cQ5MJS3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam20cQ5MJS3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam20cQ5MJS3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam20cQ5MJS3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam20cQ5MJS3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms